肾囊肿3厘米不严重，肾囊肿是一种常见病，是一种良性疾病。对于肾囊肿小于4厘米都不需要进一步的重视。对于肾囊肿在4-5厘米应该注意每半年复查一次b超，观察囊肿是否有明显的增大。
根据描述这种症状多考虑是泌尿系感染或前列腺疾病引起的，与肾囊肿关系不大建议最好去医院就诊化验尿常规明确诊断。也可以口服氧氟沙星，多喝水，禁辛辣刺激性食物，多休息。
囊肿形成以后是不能自愈的，通常囊肿会越来越大。较大的肾囊肿通常会引起临床症状，表现为腰部酸胀疼痛，主要是由于囊肿压迫肾包膜引起的，另外肾囊肿很容易压迫肾脏造成肾实质萎缩，影响肾功能。
当肾囊肿的直径超过3-5厘米的时候，将会对身体造成一定的伤害，手术切除囊肿刻不容缓。肾囊肿手术就是将囊肿的液体抽出，由原针头注入甲醛溶液，内囊摘除后，外囊残腔用双氧水杀死头节，再用生理盐水冲洗，不用担心，肾囊肿切除是微创手术，没有危险。
肾囊肿半年是有可能长到4厘米大的。如果肾囊肿较小，直径没有超过五厘米，而且没有症状，可以先观察，半年到一年复查一次。如果肾囊肿的直径超过五厘米，患者腰疼，反复泌尿系感染，尿路梗阻，血尿等，就需要采取相应的措施进行治疗。
肾囊肿比较大了，肾囊肿靠药物是无法治疗的，不管中药还是西药都不行，由于单纯性肾囊肿多无症状，对肾功能和周围组织影响不大，因此不需治疗，只要6个月到1年随诊。如果囊肿直径较大，超过5cm或产生周围组织压迫症状，引起尿路梗阻，则需要行囊液抽吸术并囊内注射硬化剂。如果囊肿巨大，直径超过10cm则可能需要手术治疗。