三个月宝宝咳嗽、鼻塞可能是呼吸道感染导致的，具体分析如下：
三个月宝宝咳嗽、鼻塞，可以判断存在呼吸道感染。常见的有打喷嚏、发烧、咳嗽、流鼻涕等症状。建议带着孩子到医院检查一下血常规和炎症指标，看是不是病毒感染引起的，还是细菌感染引起的。如果是病毒感染，可以服用一些抗病毒的药物。如果是细菌感染，可以服用抗炎的药物。要注意肺部感染，要做胸部X光检查。
咳嗽是一种保护性反应，人体的气道中有很多的咳嗽感受器，当受到刺激时会发生咳嗽。孩子夜间咳嗽有两种可能，一种是孩子本身有感染、炎症、分泌物，白天不咳是因为孩子的分泌物比较少，白天孩子通常是活动的，但是到了晚上，由于孩子大多处于睡眠状态，所以晚上睡觉时身体不动，分泌物就会积聚在某个地方，如果引起咳嗽，就会引起咳嗽。
对于感染性咳嗽，可以使用消炎化痰等消炎的药物。而且，夜间咳嗽的原因与过敏性咳嗽有关，因为在夜里睡觉的时候，棉被、枕头等都是粉尘的聚集点，我们在睡眠中暴露于这些变态反应源，也会导致咳嗽。要找到孩子晚上咳嗽的原因，看看是因为感染或者是过敏导致的，这样才能对症治疗。
一般情况下，宝宝咳嗽半夜发烧白天没事可能是由于呼吸道的炎症所致。具体分析如下：
孩子晚上会发烧，白天没什么问题，这是因为体内的荷尔蒙的水平和昼夜的周期不同。白天的时候，孩子的生理功能会快速的运行，到了夜晚，体内的荷尔蒙含量会降低，会出现发烧的情况。此外，夜晚的时候，孩子的大脑会进入一种睡眠模式，白天受到的短暂压制也会随之消失，孩子不但会发烧，还会发烧；其次，婴儿体内的水分含量要高于成年人，一旦脱水就会影响到人体的热量。夜晚婴儿的流入量相对较小，因此夜晚易于发烧；有的父母在睡觉之前就会让孩子摄入高卡路里的食品，例如奶类和其他的营养物质，这样孩子睡觉后会因为消化不了而产生大量的卡路里，从而导致发烧；另外，习惯于夜间为婴儿盖被子，也会导致散热降低；白天和晚上对宝宝的关心度不同，晚上会感觉孩子在发烧。
咳嗽是一种保护反射，用于排出呼吸道中的杂质或分泌物，也可以是由于过敏所致的气道反应性升高所致.
孩子的咳嗽不伴有发烧或者是良好的心境，这是由病毒感染引起的，也可以是过敏性咳嗽，需要配合其他相关的临床表现以及相关的检查来判断，建议去正规的医院进行诊断，根据病因进行止咳，平时要多吃一些清淡的东西，不要吃太多的盐，不要吃太多的东西，多吃一些东西，多喝一些东西，多休息。
需要确定一下导致孩子咳嗽病因，具体是因为支气管炎还是咽峡炎等方面的问题，需要选择在确诊病因下再考虑针对性治疗的问题，需要通过服用抗炎抗病毒以及镇咳祛痰等方面的药物治疗的，必要时配合平喘的药物。
一般是过敏性咳嗽了，可能与环境因素有关系。也可能是呼吸道感染引起的。需要做呼吸科检查，找到咳嗽的原因治疗，可以点穴疗法，按摩疗法。不要吸入刺激性以及有害性的气体。
