流脑是由于细菌感染的脑膜炎症，乙脑是由于病毒感染的脑实质的病变，也就是大脑炎。两种疾病所使用的药物是明显不同的，流脑通过自己的治疗，会完全康复的，大脑炎的病症比较严重，通过治疗部分患者，未留有后遗症状。
脑膜炎双球菌疫苗就是流脑疫苗，并不是乙脑疫苗，不能混为一谈，其实乙脑也就是们所俗称的流行性乙型脑炎。注射流脑疫苗是为了预防流行性脑脊髓膜炎。所以脑膜炎双球菌是流脑。
癫痫不可以接种乙脑、流脑、白破这类的疫苗。癫痫是大脑皮层异常放电所致的临床综合征，其临床表现特点为发作性、短暂性、重复性和刻板性。癫痫是神经系统的常见疾病，癫痫不是一个独立的疾病，而是一组疾病或综合征。
乙型脑炎是由乙脑病毒引起的自然疫源性疾病，经蚊媒传播，流行于夏秋两季。无明显前驱症状，可有发热、食欲不振、轻度嗜睡、大儿童咳嗽药头痛，婴幼儿可出现腹泻。药物治疗为肾上腺皮质激素及其他治疗，对重症和早期确诊的即可应用，待体温静至38摄氏度以上持续两天即可逐渐减量，不宜超过七天。
乙脑炎的症状通常是反应速度变慢、记忆力见图等。
乙型脑炎病毒可能会导致乙型脑炎的发生，通常会影响到中枢神经。乙型脑炎的临床症状通常取决于病变的位置和病变的范围。如果是额叶，颞叶病灶发生病变，通常会有精神上的不正常的情况，患者的反应也比较慢。如果是额叶、顶叶、颞叶的病变，可能会导致癫痫的发生。也有部分患者出现海马体受累的情况，可能会导致认知能力的减退，出现记忆力减退，计算能力下降的现象，时间和空间定向力也会受到影响，甚至会出现偏侧肢体的活动不灵活，偏侧肢体的麻木等症状。
