手掌腱鞘囊肿的治疗方法是保守治疗、手术治疗等。
手掌腱鞘囊肿一般都会在局部出现一个小肿块，这会对患者的生活造成一定的干扰，甚至会导致局部疼痛。一般情况下可以进行手术切除，手术切除的时候要注意保护好肌腱，同时要注意伤口的清洁和更换药物。此外，患者平时多休息，同时也要保持合理的饮食，不要吃刺激和油腻的食物，可以多吃新鲜的蔬菜和水果。
腱鞘囊肿主要是由于肌腱和腱鞘的反复磨蹭所致，多发生在手足和后背，很少发生在掌部腱鞘囊肿。如果是腱鞘囊肿，会压迫周围神经、肌腱等，导致疼痛或者行动受到限制，一般都是要手术的。手部的血管和神经很细，需要在外科医生的帮助下进行鉴别和保存。为了避免伤口的恢复和术后的复发，术后应及时刹车。建议在医生指导下服用2-3天的抗生素来预防感染。
通常来说，手掌腱鞘囊肿建议进行一般治疗、手术治疗等。
如果症状比较轻微，手掌腱鞘囊肿通常不会表现出特别的表现，因此不需要特别的处理；如果症状较重，一旦发现有局部的压迫和痛苦就应该采取相应的措施。首先要做的是局部的止血，尽量的减轻人工的疲劳，同时可以用针头进行局部的抽吸，然后用乙酸泼尼松龙进行压力的治疗。如果上述方法没有明显的改善，可以考虑进行外科手术，去除肌腱鞘囊肿。
足背腱鞘囊肿的治疗方法主要包括非手术治疗与手术治疗。
非手术治疗简便易行，多采用外力冲击挤压使囊肿破溃，囊壁破溃后囊液从破溃口排出，自行吸收，晚期局部黏连痊愈，但也有少数病人因肢体活动不受限，存在反复发作的危险。足背之腱鞘囊肿多发于足背动脉外趾长伸肌腱鞘。一般在2cm以下。经外力挤压效果不佳，需手术将囊肿彻底清除以防复发。
通常情况下，手部腱鞘囊肿的患者可以通过使用药物、手术治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
使用药物：手部腱鞘囊肿的患者以在医生指导下使用阿司匹林片、氢化可的松片、甲氨蝶呤片等药物进行治疗。
手术治疗：手部腱鞘囊肿的患者，囊肿多可自行吸收消失，较大囊肿且张力又不大而挤压无效时，可进行手术切除囊肿，术式有关节镜手术和传统切开手术。
腱鞘囊肿的治疗方法有非外科治疗、外科疗法等。
1.非外科治疗：尽管对肌腱鞘囊肿的术后复发有很高的复发，但是这种手术损伤最少，容易被病人所接受，是临床上的第一选择。可以用压迫法将腱鞘囊肿撕裂，慢慢的吸收，但在处理后会出现反复。与关节腔相连的不易断裂，可用针刺取囊内液体，再进行挤压，或取出囊内液体。
2.外科疗法：如果没有其它的治疗手段，可以通过外科手术将其去除。为了防止疾病的再次发作，手术时要尽量减少剧烈的运动。
需要注意的是，少数腱鞘囊肿可自行消退，但也有部分患者经多种方法治疗，仍反复发作。