应该根据患儿疑似先天性心脏病的疾病类型，决定是否打预防针。有些是不可以打预防针的。
一些先天的疾病，可以接种疫苗。就像是室间隔缺损、室间隔缺损等，缺损的区域不大，不会对心肺功能造成任何的损害，可以打疫苗。主要是出现了严重的心脏机能紊乱。接种疫苗后会有一些副作用，比如发烧。具体情况需要遵医嘱，不要延误治疗。
先天性心脏病。应该根据患儿疑似先天性心脏病的疾病类型，决定是否打预防针。有些是不可以打预防针的。有些先天性心脏病，可以打预防针。比如常见的房间隔缺损、室间隔缺损等，缺损面积比较小，不影响心肺功能，可以注。射预防针。
简单的先心病，如卵圆孔未闭存在1-3mm分流，对小儿血流动力学和整个循环状态无影响，可以定时注射预防针；动脉导管未闭、室间隔缺损、法洛四联征、大动脉转位等先心病患儿，在未进行合适手术和解剖矫治的前提下，不能进行预防接种。临床常用疫苗为减毒活疫苗，先心病患儿常伴有不同程度的免疫缺陷，接种减毒活疫苗后可进入体内被激活，患病风险较大。
孩子有先天性心脏病等是可以接种疫苗的。应该及时到医院选择安排打针即可，建议多注意休息保暖，注意食欲和睡眠的情况是否正常，可以推迟一段时间给孩子体检即可。对于有些先天性心脏病，症状比较重，有心功能，障碍的表现。当接种疫苗以后，可能会出现发热等不良反应，容易加重先天性心脏病的病情。
小儿先天性心脏病可以打疫苗的。如果不能按时接种疫苗，先天性心脏病患儿本身体质就弱，加上不能正常预防各种传染病，就很容易感染传染病的，这样，对本身体质弱的患儿更是雪上加霜，所以说，预防针对先天性心脏病患儿不会有什么影响的，应该正常接种比较好。
一般情况下，婴儿先天性心脏病，如房缺型、室缺型、冠状动脉栓塞、肺动脉狭窄等，均能自我康复，但需要长期随访，并进行严密的观察。如有较大的缺陷，可采用介入或外科的方法进行处理。如果有肺动脉阻塞、肺静脉异位引流症、大血管转移等并发症，有可能伴随着体能下降、心力衰竭、出现呼吸道感染、肺动脉阻塞等情况，需要紧急处理。