小儿急性胃肠炎的治疗方式主要有药物以及日常护理。
儿童急性肠炎可吃思密达，必奇等，能保护胃肠粘膜，固化杀灭肠道内细菌和病毒，起止泻作用。如果腹泻严重时还需配合口服抗生素治疗。微生态制剂有妈咪爱，常乐康，金双歧，整肠生，以调整肠道菌群为主，抑制肠道有害细菌的生长，达到止泻的效果。另外还需要注意合理使用抗生素及对症处理。同样也要注意适当进清淡的饮食，让消化道得到适当的休息。
对于哺乳期胃肠炎治疗；因为是哺乳期建议不要用药；首先要卧床休息，保暖，并且禁食12小时，以后逐渐进少量流食，如米汤、藕粉，或稀粥、面汤等，慢慢地恢复正常饮食。腹泻严重的可吃些烤焦的馒头片或糊米粥以收敛止泻。
小孩胃肠炎发烧要注意观察大便的颜色，不吃辛辣刺激的东西与生冷的东西，平时注意腹部保暧。平时注意多喝温水，必要时查一下血分析与大便常规，排除感染，严重时注意输液，防止脱水。
胃肠道功能不好与饮食习惯有关，需要进行饮食调理，给孩子生活规律，一日三餐按时定量进食，多进食水果蔬菜及易消化的粥类，汤类，避免吃油炸，烧烤，辛辣刺激食物。但如果是急性胃肠炎，有可能会出现上吐下泻，这个时候要赶紧带着孩子去医院，有可能是食物中毒，或者是吃坏的东西的。
在尽早送到医院的前提下，积极给小孩补充水和电解质，即使是喝盐水对小孩的帮助也很明显。就是应用抗生素和抗病毒药。因为导致小孩患上胃肠炎的原因，主要就是病毒和细菌，及早应用抗生素和抗病毒药，对于小孩的预后非常好，也会缩短病情，使小孩的病情能够迅速好转。
