为了有效的预防乙肝病毒的传染，乙肝疫苗的免疫接种纳入基础的接种范围以内，孩子出生以后，按照0-1-6月份的时间进行正规的疫苗接种。新生儿的母亲是乙肝病毒感染者，尤其是大三阳的患者，孩子出生以后，除了正规进行疫苗的接种，还需要使用乙肝高效价免疫球蛋白，一般在出生后24小时内尽早使用，然后在半个月以及一个月的时候，分别再次使用，可以有效的预防乙肝病毒的垂直传染的发生。
新生儿接种疫苗的时间首先宝宝刚出生的时候要在医院打疫苗，乙肝疫苗。等宝宝1个月的时候，还要再打乙肝疫苗。宝宝2个月大的时候，打脊灰疫苗。在宝宝3个月的时候，打脊灰疫苗和百白破疫苗。等宝宝4个月打的疫苗是脊灰疫苗，百白破疫苗。5个月还继续接种百白破疫苗。
新生儿接种乙肝疫苗需要在第一天接种第一针，第二针在30天内打第二针，180天打第三针。
现在普遍认为三次乙肝疫苗能够促进人体的免疫，从而降低乙肝病毒的感染几率，降低母亲的垂直传播的危险。不过，接种了乙型肝炎疫苗并不意味着就能得到保护的抗体，而保护性抗体的生成与自身的免疫力有关，因此需要在一周岁左右做一次血液检测，检测到乙肝两对半，以确定是否得到了保护的抗体，如果乙肝表面抗体为阴性则需要进一步接种。
新生儿出生后要接种乙肝疫苗、卡介苗，卡介苗是在生后2-3天至2个月内接种。1个月时接种乙肝疫苗，2个月时接触脊髓灰质炎疫苗，3个月时接种脊髓灰质炎疫苗和百白破疫苗，4个月时接种脊髓灰质炎疫苗和白百破疫苗，5个月时白百破疫苗接种，6个月时接种乙肝疫苗，8个月时就要接诊麻疹疫苗，一岁半到两岁时接种白百破疫苗，4岁时脊髓灰质炎疫苗接种，6岁时麻疹疫苗复种、百白破疫苗复种。
新生儿时期接种预防针以2种为主，乙肝疫苗及卡介苗针。
孩子生下来以后在分娩室或者手术室打维生素k1主要是为了防止流血。乙肝疫苗在出生后24小时注射，第2针注射时间为出生后第30日，第3针注射时间为第3个月。
卡介苗针用于防治结核病，通常可在出生后24小时内注射，至迟在三个月内注射。如新生儿时期存在疾病因素而没有接种卡介苗的，三个月后去接种站打针均可。
新生儿肺炎疫苗3个月大的宝宝就可以打了，5岁以下的宝宝也都可以打。小儿肺炎球菌结合疫苗可以用于预防2岁以下宝宝的肺炎球菌感染，但是这个只能弥补2岁以上儿童缺憾。
