治疗肺炎可以选用青霉素类和喹诺酮类的抗生素。用何种抗生素能治疗肺炎，取决于感染的病因。病毒性肺炎，抗生素不能起到作用，可以口服抗病毒的药物。真菌性肺炎要用抗真菌药物进行治疗。在出现细菌性肺炎时，要依据病原菌的不同。如果是由革兰氏阴性杆菌引起的，应根据药物敏感性，选用抗菌药物或其他敏感药物。如果是支原体、军团菌等引起的肺炎，可以口服抗生素。
肺炎球菌性肺炎确诊之后，通常选青霉素类的抗生素治疗。治疗方法和剂量取决于病情的严重程度和是否有并发症，成人轻度的病人可以每日240万单位，分为三次肌肉注射。较严重的病人，每日给予240万-480万单位的青霉素，每6-8小时分次静脉滴注一次，严重的脑膜炎病人可以增加到一千万到三千万单位，并分四次进行静脉注射。对青霉素过敏或有多种耐药性的患者，可以使用喹诺酮类、头孢类药物，对多种耐药性的细菌进行治疗。
肺炎链球菌肺炎治疗的首选抗生素药物有青霉素和头孢菌素。肺炎链球菌的首选是β-内酰胺类抗生素。这种抗生素主要针对细菌的细胞壁，可以破坏细菌细胞壁的完整结构，杀灭肺炎链球菌，获得良好的治疗效果。酰胺类抗生素有过敏反应，选择其他类型的抗生素，如大环内酯类抗生素或氟喹诺酮类抗生素，或选择肽类等药物治疗。在日常生活中还应该注意清淡饮食，避免辛辣刺激性的食物。
如果肺炎不经过治疗，同时患者抵抗力下降，这些情况会导致炎症蔓延加重，出现肺实变或者病变融合。肺组织坏死之后容易形成多发性空洞和脓肿，还可以波及到胸膜引起胸膜炎、胸腔积液、脓胸等，可引起肺功能出现下降而导致呼吸困难。同时严重的炎症反应会产生极多的毒素，波及到心脏引起中毒性心肌损害。
肺炎需要治疗多久无法确定，因为治疗时间具体取决于肺炎的类型，以及个人病情的轻重、治疗情况、方法等。链球菌感染需要2~3周，对于大肠杆菌导致的肺炎可能需要4~8周的治疗时间。因此在给孩子选择用药治疗时应该要找到引起疾病的病因后用药，可以缩短疾病疗程。
