精索静脉曲张术后的并发症有四种：炎症、出血、睾丸萎缩、输精管阻塞。如果是早期的并发症，比如睾丸萎缩和输精管堵塞，都是比较严重的并发症。手术中一旦发现有炎症，应立即应用抗生素，但如果在结扎过程中，结扎的绳子会掉落，导致手术区内出血，必须重新进行止血。术后出现严重的并发症，可能是因为手术时对精索血管和输精管造成的。
精索静脉结扎术后水肿是常见的并发症，发生率为3%～33%，平均为7%，淋巴管损伤或被结扎是引起水肿的原因。术后睾丸萎缩或精子缺乏，多数是由于手术时结扎或损伤睾丸动脉引起。动物实验和对人的研究表明，睾丸动脉结扎会很大程度地引起睾丸损害，尤其是不育症得病人。
不会消失，精索静脉曲张的手术只是在血管曲张的地方进行一个血管结扎的手术，所以不会把全部的静脉曲张血管都剔除掉，所以在手术以后不会出现完全消失的，也会保留一部分，一般手术后的修复也是很关键的。手术以后需要多卧床休息。
精管损伤输精管损伤是精索静脉曲张手术的一种严重并发症，因术中需要将精索静脉结扎，所以很容易误扎输精管及其动脉。输精管是一种呈白色，且触之质地坚韧的管状结构组织，与周围血管等颜色和结构略有区别，需引起高度重视。局部疼痛部分精索静脉曲张行结扎术后会出现腰背部、睾丸等处的疼痛症状。
精索静脉曲张，会导致疼痛不适，睾丸功能减退。这属于男的不孕不育的一个重要的病因。应当在生活方式。多进行调理应当戒烟饮食上面，也应当要清淡。可以采取手术进行治疗。
精索静脉曲张未能及时治疗精索静脉曲张会给生活和工作带来不便，并影响生育能力。一对生活和工作不便：精索静脉曲张会导致阴囊疼痛，给工作和生活带来不便。二对生育能力的影响：精索静脉曲张导致男性不育的机制与精子质量异常、睾丸体积缩小、睾丸灌注减少和睾丸功能障碍有关。精索静脉曲张也可能损害附睾功能，导致疼痛和不适等症状。这种疾病是男性继发性不孕的常见原因之一。这种症状会在站立和剧烈的活动后加重，休息后减轻。同时会导致阴囊潮湿出汗。这些都是精索静脉曲张的危害。