三个月宝宝消化不良可以采取药物治疗和物理治疗。
家长可以给三个月宝宝应用山楂或者麦芽给孩子熬水喝，从而可以起到消食、助消化的作用。其次是给三个月宝宝按摩，可以按揉儿中脘穴，中脘穴位于肚脐眼向上4寸的部位。可以用中指点揉中脘穴，从而起到良好的助消化作用。此外是给三个月宝宝服用消食化积的中成药，比如小儿消积止咳口服液。
宝宝出现消化不良的症状，会出现恶心、呕吐、腹胀、食欲不振。具体内容如下：
如果有这个症状，可以进行按摩，通过顺时针方向的推拿，可以促进肠胃的运动，有助于消化。同时要注意保护孩子的身体，避免感冒，可以多喝粥、蛋黄粥、蔬菜粥等，避免食用辛辣刺激的水果，避免引起肠胃不适。避免食用过热食物，过热类的食物会刺激溃疡面，导致疼痛感加剧，严重情况下使得溃疡面发生血管扩张，引发出血。避免食用辛辣类食物，该类食物会刺激溃疡面，增加胃酸分泌。
宝宝经常出现消化不良的问题，多是因为脾虚所致，脾不好，就会影响胃的消化功能，长期堆积后，就会导致宝宝消化不良的情况出现，可以通过健脾药物、推拿按摩来改善。
一、健脾药物
健脾药物可以选择丁桂薏芽健脾凝胶。它的成分安全，有山药、大枣、薏米、山楂等药食同源的成分，不仅能够帮助宝宝开胃消胀，还能从根源健脾，改善经常消化不良的问题，并且口味是酸甜果泥味，宝宝在消化不好的情况下更易接受。
二、推拿按摩
日常要做到宝宝的保暖工作，避免腹部着凉，可以适当的对宝宝进行推拿按摩，可以沿着宝宝的脊柱两侧，从腰部往上捏，直到颈部结束，要让宝宝感到舒适，不能过于用力，这种方法可以改善宝宝消化不良的问题。
观察宝宝的病情，是生病了闹的不消化还是吃了什么食物导致的。如果是生病导致消化系统减慢，而出现的消化不良，这个需要找出根源，让宝宝的病情治疗痊愈，才能慢慢的回复内部的消化。
通常情况下，宝宝吃多了消化不良可以通过运动、药物调理。
宝宝吃多了消化不良，主要是因为吃的超过消化能力，一般应该在宝宝吃了饭后，带宝宝适当的运动，比如散步，能促进肠蠕动，帮助孩子胃排空，有利于改善消化的功能。另外还可以给宝宝补充益生菌，调理肠胃功能或服用一些消食健脾胃类的中成药，如婴儿健脾散、四磨汤口服液等。
退烧要避免这种情况反复发生，要做好宝宝的饮食管理，每次不要吃得太饱，要规律饮食，合理的搭配饮食。
一般情况下，宝宝消化不良、吃完就拉可能是脾胃不好导致的。可以适当让宝宝喝小米粥、黑米粥、红薯粥等温热并且易消化的食物，来健脾益胃，改善宝宝消化不良、吃完就拉的症状。如果除消化不良、吃完就拉外，宝宝还有腹痛、腹泻、等不适症状，可以在医生指导下使用醒脾养儿颗粒、双歧杆菌三联活菌胶囊、乳酸梭菌活菌散等药物来进行治疗。
