肺炎链球菌肺炎的治疗，首要在于判断链球菌的耐药性，根据是否耐药选择合适的抗生素进行治疗。一般来说，非耐药性肺炎链球菌选择头孢或者左氧氟沙星，正规治疗7天左右，患者的症状能够很好的缓解，之后可以慢慢减少抗生素的使用量。过程中要观察患者的症状是否出现了反复，选择的抗生素不合适或者药物剂量不足，都会影响患者的治疗效果。
肺炎链球菌肺炎治疗的首选抗生素药物有青霉素和头孢菌素。肺炎链球菌的首选是β-内酰胺类抗生素。这种抗生素主要针对细菌的细胞壁，可以破坏细菌细胞壁的完整结构，杀灭肺炎链球菌，获得良好的治疗效果。酰胺类抗生素有过敏反应，选择其他类型的抗生素，如大环内酯类抗生素或氟喹诺酮类抗生素，或选择肽类等药物治疗。在日常生活中还应该注意清淡饮食，避免辛辣刺激性的食物。
肺炎链球菌肺炎的治疗方法主要是通过抗生素做治疗，选用的抗生素一般是头孢类和青霉素类，在经过治疗后，可以明显的见好转。肺炎连球菌肺炎主要是因为感染连球菌导致的，感染后，多数呈大叶性肺炎，主要症状是咳嗽有痰，并且伴有胸闷胸痛一些症状，有一部分严重的患者，还会出现呼吸困难。在平时要，多喝水，多吃新鲜的水果蔬菜，禁止吸烟吸，烟对肺非常不好。
由肺炎链球菌感染引起的肺炎叫肺炎链球菌肺炎。肺炎链球菌肺炎的症状主要表现为，病人口唇有疱疹、有寒战、高烧、咳嗽、有铁锈色痰，病情严重时还有可能会出现呼吸困难，波及到胸膜时，胸痛会比较厉害。肺炎链球菌肺炎可以采用青霉素进行治疗。青霉素治疗效果不好时，可以改用其他头孢类的药物进行治疗，一般治愈率比较高。
一般情况下，小儿肺炎链球菌肺炎要做体格检查、血常规、C反应蛋白测定、尿常规、病原菌检查、血清学检查等检查。
1.体格检查：根据胸腔症状的初步判断，初期仅是轻微的叩诊声或微弱的呼吸声。病程2~3天，肺实变后出现明显的叩诊浊音、语颤增强和管状呼吸音，偶尔可见罗音。临床上，肺功能指标无明显改变，但术后恢复时出现的湿罗音增加，个别患者无明显的胸腔表现。
2.血常规：主要是为了确定小儿的感染和感染的情况，这种疾病的患者的白细胞总数会升高。
3. C-反应蛋白检测： C-反应蛋白的检出率可达到96%，用于诊断儿童的急性感染。
4.尿常规：对小儿进行尿检，检查是否含有少量的蛋白质，以便诊断。
4.病原菌检查：通过呼吸道分泌物、血液和胸腔积液的培养，可以发现感染的细菌。痰液涂片、镜下观察，如有革兰阳性、成对排列的双球菌，痰和血液中有无肺炎链球菌的增殖可以确诊，但阳性率较低。
6.血清学检查：10%~30%的小儿感染了肺炎，而对其病因的鉴别主要是依靠血清学检测。通过测定小儿血清、尿液、尿液中的肺炎链球菌抗体，同时采集血、尿标本，用 CIE、 LA等方法测定。
肺炎链球菌肺炎，还是进行痰培养，选择对症的消炎药治疗，肺炎链球菌也会出现耐药，所以痰培养是很重要的。其次，如果有缺氧的现象，需要给氧治疗，密切观察病情变化，防止出现并发症。最后晚期如果出现感染性休克、颅内高压，应对症进行抢救。