通常情况下，3个月宝宝腋下体温39摄氏度，家长可以通过使用药物、日常护理等方式进行治疗。具体情况分析如下：
使用药物：3个月宝宝腋下体温39摄氏度说明宝宝发烧了，家长可以按照医嘱给宝宝使用小儿解感颗粒、小儿氨酚黄那敏颗粒、小儿柴桂退热颗粒等药物进行治疗。
日常护理：3个月宝宝腋下体温39摄氏度，家长应注意及时给宝宝添衣，给宝宝多喝热水，注意保持宝宝的房间温度适宜，以促进宝宝身体的恢复。
如果孩子的额头温度不高，如果是腋下38℃，可以通过物理降温的方式进行治疗，比如多喝温开水、温水擦浴、贴退热贴等，还可以用温水泡脚、冰敷腋下等。
如果能服用药物，可以口服小儿柴桂退热颗粒进行降温治疗，具有解表退热的功效。要注意宝宝的精神状况，可以喝水、吃东西、喝奶。如果孩子以前有高热惊厥、抽搐的历史，可以服用布洛芬或者对乙酰氨基酚来进行降温治疗。
发烧了，属于中度发烧，可以喂些退烧药，另外也可以用冷毛巾或是酒精进行物理降温，发热的原因很多，家长应仔细观察宝宝是否还有其他症状，多给孩子喝点水，吃水果，如果症状不减轻，应去医院儿科就诊。
婴儿的腋下淹了，是由于出汗或者是腋下经常潮湿不干爽而导致。首先给宝宝勤洗澡，保持皮肤的清爽，洗完澡之后腋下立刻擦干。如果淹的情况比较严重，可以给宝宝涂一些保持干爽的爽身粉，但是爽身粉一定要薄薄的涂一层，以免造成毛孔的堵塞。
汗液的成分除了水分外，还有蛋白质、脂肪酸、胆固醇等。当表皮葡萄球菌和金黄色葡萄球菌等细菌分解汗液时，会产生氨、丙酸、异戊酸、苯并噻唑等，导致酸味和臭味。此外，汗液中排出的尿素，也带有臭味，分解后，尤其严重。如果食用高蛋白、高脂肪食物，会导致臭味加重。平时注意清洁，定期更换衣物，洗澡可以减轻异味。如果腋下汗腺丰富，臭味会更加明显。
物理降温，包括松解衣物、温开水擦洗、退热贴等。对于低热的宝宝，无其他伴随症状，可优先选择，效果较好。监测体温变化，如体温进一步升高，口服退热药物。如果宝宝腋温超过38.2度或者因发热情绪低落有明显不适时，可以输液或者雾化来治疗。
