药物流产的最佳时间是怀孕40天到两个月之间。
女性可以选择通过药物流产或是人工流产，如果采取药物流产的话，需药服用米非司酮软化宫颈，再服用米索促进孕囊的排出。最好在怀孕40天到60天之内服用药物，可以保证子宫损害程度较小，如果出现胚胎发育成熟后用药物流产流不干净的情况，如果宫腔内有残留物，还需要前往医院进行清宫。
一般来说，做药物流产的最佳时间是妊娠49天之内。药物流产通常可以杀死胚胎，然后使胚胎从阴道排出，所以一般适用于比较小的胚胎。49天之后胎儿已经比较大了，而且也形成了骨骼，药物流产通常很难完全把胚胎排干净，排不干净可能会导致长期的流血和子宫内的感染，做药物流产一般使用的药物是米非司酮和米索前列醇，需要遵医嘱用药。如果妊娠超过了49天，患者需要进行人工流产了，包括负压吸引术和钳刮术。
药物流产比较好的时间是在停经的49天之内，此时行彩超检查如果提示孕囊大小合适，就可以进行药物流产。药物流产前要常规进行肝肾功能的检查、血常规、快速四项的检查等。
一般情况下，药物流产的药通常是米非司酮片、米索前列醇片等药物。如患者采取药物流产方式终止妊娠，应在医生指导下先吃米非司酮片进行杀胚，再吃米索前列醇片来促进子宫收缩、将胚胎排出体外。为较好实现终止妊娠的目的，患者应在早上遵医嘱吃药，在吃药前后两个小时内患者应避免进食。药物流产后，患者应及时就医，明确子宫内是否有残留胚胎组织，必要时行清宫手术进行治疗。
怀孕45天-50天通常可以药物流产。
在进行药物流产前首先要明确是否存在宫内早孕的情况，明确了宫内早孕后，在怀孕45-50天时通常比较适合进行药物流产。在药物流产前应进行相关化验，明确流产禁忌，做好阴道清洁。不过药物流产通常会对身体造成很大的损伤，可能引起出血、感染、流产不全、继发性不孕、月经不调、子宫内膜异位症等并发症。
通常情况下，药物流产三个月以上可以再怀孕。
药物流产会导致子宫内膜会受损，引发妇科炎症，对女性身体伤害较大。因此，药流后不建议短期内再次怀孕，如果子宫内膜以及身体未恢复到正常状态，怀孕会引起孕早期流产或影响胎儿生长发育。建议在术后要注意做好身体调理和避孕措施，避免再次怀孕，
药物流产三个月后可以去医院做相关检查，看子宫内膜和身体是否恢复正常状态，适合备孕的情况下再考虑再次怀孕。
