对泌尿生殖道支原体和衣原体感染治疗、多采用四环素类、大环内酯类、喹诺酮类及大观霉素、克林霉素等抗生素、一般疗程为7～10天.如果细菌培养发现有耐药菌株存在，进行药物敏感试验、以便选择敏感药物进行治疗。
男性得了支原体感染可以通过药物进行治疗。
如果有支原体感染，可以通过口服莫西沙星、左氧氟沙星等氟喹诺酮类药物，以及大环内酯类抗生素。在服药的过程中要根据患者的病情进行适当的调整药物的用量，以达到改善病情的目的。男性要注意个人卫生；平时要多饮水，促进身体的新陈代谢，不要抽烟、喝酒。
一般情况下，小孩总是支原体感染，家长可以通过使用药物、补充营养等方式进行处理。具体内容如下：
1.使用药物：如果小孩支原体感染没有治疗彻底，可能会出现感染情况反复的问题，家长可以遵医嘱给小孩使用阿奇霉素片、注射用头孢曲松钠、阿莫西林分散片等药物进行治疗。
2.补充营养：如果小孩营养不良，可能导致身体虚弱，从而出现总是支原体感染的情况，家长可以多给小孩补充营养，均衡饮食，提高免疫力。
肺炎引起的支原体感染首先注意休息，放松心情。饮食宜清淡，多喝白开水，忌食辛辣刺激性食物。支原体肺炎的一个主要特征是肺内有少量的阳性体征和清晰的影像学特征。病灶边缘模糊，密度低，由肺门向外周肺野辐射，在肺实变受累时亦可见大片实变影。与一般细菌性肺炎所见下肺只有一处实变影或片状浸润相比较，支原体肺炎侵犯上肺者或双肺者多，但其吸收缓慢。
男性支原体感染一般以呼吸道感染和泌尿道感染等为主，不同感染治疗方式不同。
1.呼吸道感染：肺炎支原体感染是导致呼吸道感染的原因之一，患者主要是应用抗菌药治疗，可适当给予小剂量镇咳剂和祛痰药。
2.泌尿道感染：患者应进行抗感染治疗，治疗药物主要包括大环内酯类、四环素类等抗菌药，具体用药谨遵医嘱。
小孩支原体感染咳嗽半年没好应该带小孩去医院用输液抗炎治疗，多给小孩喂开水，注意观察小孩各方面的情况。注意保暖，避免着凉。一般需要治疗半月才能控制病情，严重的支原体感染孩子可以咳嗽一个月以上。
