要区分异位妊娠和生化妊娠，最重要的是依靠症状和相关辅助检查。从症状上看，异位妊娠常见症状是经期腹痛和阴道出血，腹痛，无异位妊娠流产或破裂，表现为一侧腹胀不适或疼痛。如果发生流产或破裂，则在下腹一侧会表现出剧烈的泪液样疼痛，并伴有休克变化，如血压下降，湿冷，面色苍白，脉搏计数等。生化妊娠有月经停止和阴道出血的症状，但没有明显的下腹痛症状。
先兆流产和宫外孕早期都有不规则阴道出血时多时少有时伴有小腹下坠或疼痛这需要做彩超才能确诊。先兆流产是宫内妊娠因子宫内膜簿，或黄体功能差，或因外部撞击，性生活及营养不足及胎儿发育不好。宫外孕因输卵菅通而不畅使孕卵不能到子宫就在输卵管内生长。
生化妊娠就是精卵结合后没有着床，直接通过阴道排除体外的现象，属于流产的一种原因，生化妊娠愈合良好不会影响以后受孕，而宫外孕是精卵结合后由于输卵管的炎症或子宫内膜的炎症使受精卵没能很好的在子宫内膜着床，从而着床在输卵管或其他部位。
一般生化妊娠是受精卵着床不成功导致的阴道出血，宫外孕流产是宫腔内没有孕囊的情况下有阴道出血。一般生化妊娠和宫外孕自然流产一般是不容易区分的。可能是宫外孕流产出血，一般不容易区分。
生化的妊娠是由于精子和卵子结合之后，还没有进入子宫就已经排出。首先妇科彩超不会提示附件有包块，子宫内也不会有孕囊，HCG也比较低，并且会随着1次的出血，HCG就会迅速的恢复正常。而宫外孕提示附件可能会有包块，并且HCG的正常值高于正常的范围。
生化妊娠和宫外孕差别很大。生化妊娠是指发生在妊娠5周内的早期流产。宫外孕就是指受精卵在子宫腔以外着床发育的，以输卵管妊娠最为常见。宫外孕和生化妊娠可以清楚地区分开的，怀孕后要定期到医院做检查。
