隐睾手术后睾丸萎缩可能是多种原因导致的，具体分析如下：
隐睾切除术需要切断精索和输精管，这样才能将睾丸拉入阴囊。隐睾术后出现睾丸萎缩，首先要考虑的是睾丸本身的发育，睾丸本身的发育不全，导致睾丸出现萎缩，同时也会出现恶性变化，精索血管和输精管的血运紊乱，会对睾丸的血液供应造成一定的影响。如果睾丸萎缩，应尽早进行手术，以避免以后发生癌变。
一般情况下，隐睾手术后出现睾丸扭转，可能是医源性扭转，也可能是术后睾丸回缩而自行扭转。建议及时就医，查明病因，对症治疗。具体情况分析如下：
手术后出现睾丸扭转，阴囊内睾丸位置正常。精索和睾丸在手术中完全游离，在下降的过程中不能辨别方向，如果将精索扭转固定在阴囊上，需要手术恢复扭转角度，避免睾丸缺血坏死。另一种是睾丸在手术后回缩到腹股沟区后会自行扭转。此时阴囊内空虚，无法触及睾丸，会出现腹股沟区疼痛，B超检查提示扭转缺血，需要手术恢复扭转，再次将睾丸放入阴囊。
隐睾症是由于睾丸功能的异常，导致睾丸无法正常地向阴囊的方向移动，而是滞留在腹膜后、腹股沟区、阴囊的入口处。正常的睾丸在发育过程中会自动下降到阴囊。2岁以上的孩子还没有出现隐睾的症状。
隐睾对睾丸生精小管的生精功能有一定的影响，而且睾丸很容易受到温度的影响，从而导致精子发育障碍，成年后会出现不孕，腹膜后的睾丸也会发生恶性变化。
造成隐睾的原因是胎儿后期睾丸下降到阴囊的过程中收到了阻碍，小孩子如果睾丸如果已经下降到阴囊内是不需要手术的，一岁以后睾丸自行下降的机会不多，四岁后隐睾对以后的生育就有明显的影响的，小孩的情况是到医院经检查后确诊是否需要手术。
睾丸处出现的隐痛，可能是局部的炎症造成的。到医院做一个彩色的B超化验一个血常规，需要先吃点消炎药的，多喝点水，多吃些蔬菜水果，不要吃辛辣刺激性食物。注意休息。注意卫生。