肛瘘的症状是会排脓，脓汁粘稠，黄色、味臭；瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水；若脓量增加，则表示新瘘管生成瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升。
产后肛瘘症有潮湿、瘙痒，有时形成湿疹的症状。瘿管中有脓肿形成时，可感到明显疼痛，同时可伴有发热，寒颤，乏力等全身感染症状。脓肿穿破或切开引流后症状缓解。不治疗会反复发作直肠肛管周围脓肿，因此必须手术治疗。
肛瘘常常会伴有肛周的干痒和有脓肿出现，也会使肠胃发生不适出现腹胀，腹痛的症状，排便也会受到影响，而且反复发作，长时间不愈合，和愈合以后很快又会肿痛破溃，肿痛和破溃这两种病症是交替出现。甚至伴有出血的症状。肛瘘这种病，是由肛周脓肿发展而来的。
产后肛瘘早期的症状是流脓周期性发作，时有时无，脓液较少，一般不疼，当脓液积存于管腔内引流不畅时，局部胀痛，大部分病人可在肛缘触及索条状硬块，按压轻度疼痛，肛门皮肤会伴有瘙痒或者湿疹。
肛瘘症状有局部红肿、疼痛、流脓、骚痒或湿疹，严重的还会出现发热的症状。发现症状要及时去医院检查，如果病情严重，需要手术治疗。多吃清淡富含营养的食物，不要吃油腻的食物。