治疗肛裂可以选择保守治疗，肛门局部外用乳膏，修复黏膜和止疼、止血。除此之外，还应该用生理盐水坚持肛门局部每天坐浴，同样能够起到修复创面、促进创面愈合的作用。还要注意避免刺激性饮食，保持大便顺畅。
肛裂的治疗方法很多，注射法疗是较常用的一种方法。以往多采用单纯封闭治疗，近年来研制不同注射药物治疗肛裂，收到较好效果。是以麻醉药物和长效止痛剂注射至病灶及其周围组织，解除疼痛和括约肌痉挛，使裂损创面得到修复。
对于肛裂，保守治疗2周未愈者，首选扩肛术。对陈旧性肛裂首选内括约肌侧切术。但是总的原则是首先要预防、防止大便的干结，以免再次损伤肛管皮肤，另外要促进炎症的吸收防止感染，其次要促进伤口的愈合从而达到治疗肛裂的目的。
肛裂的主要现象就是肛门疼痛和出血，如果疼痛减轻或者出血较少，就说明症状已经好转了。这时就要多注意吃一些清淡饮食，少吃辛辣的食物，并且多喝水，尽量保持大便湿润，再保持多运动就行了。
肛裂根据临床表现轻重的不一样，可以分为三期，每一期的治疗方法也有所不同。也就是轻微症状可以使一般的药物进行治疗和控制。根据症状需求可以着重选择涂抹麻醉、促裂口愈合及缓解括约肌痉挛相关药物。可以进行简易的扩肛治疗和注射肉毒杆菌毒素，可以使用手指或者器械进行缓慢的扩张，动作一定要轻柔，可以放润滑油膏，操作简单方便，对于缓解肛裂疼痛有着明显的作用，但是不能彻底治疗好肛裂，容易导致肛裂反复发作。