对于2岁以下的小孩，发病时间不超过48个小时，可以采取保守治疗。保守治疗分为两种，一种是X线的空气灌肠；一种是在B超监控下进行水压灌肠，这样小孩就不会被X线照射到，这对小孩来说是有好处的。两种方法都能获得很好的恢复效果，两种方法都能达到95%以上的治疗效果。
但如果孩子病史超过48个小时，或者是病情严重，反应不佳，而且孩子年龄在三岁以上，又是急性期，反复肠套叠，很有可能会合并器质性病变。在这种情况下，可以选择微创的手术探查，也可以选择灌肠，核素扫描。
如果症状相对较轻，应首先采取保守治疗。常用方法包括空气灌肠、钡灌肠和b超下静水压灌肠复位治疗。在治疗过程中，通过配合医生的治疗和遵循医生的指示，病情会得到改善。
肠套叠可以通过输液、灌肠、外科等方式进行处理。
具体要看孩子的情况，要看孩子的情况。一旦发现有肠套叠，必须禁食。康复后要注意以流质为主，避免立即喂宝宝有营养的食物，要逐步的多餐。程未满48个小时，身体状况良好者，可以进行B超下的肠套叠式液压灌肠，进行复位。平时要多让宝宝多睡一会儿，让宝宝周围的温度不要太高或者太凉。宝宝手术之后要注意食物的摄入，逐渐转变为半流质食物，尽量减少进食。
空气灌肠使肠套叠复位，通常是使用自动控制压力结肠注气机将Foley管置入肛门内，经肛门内注气即可见肠套叠肿块的多种图像，渐渐退至回盲部，至全部消失，这时可听到气过水声并在腹部正中骤然凸起，可见到网状或圆形的充气回肠，提示肠套已经复位。空气灌肠复位率达95%以上，成功率较高，所以患者不用过于担心，积极配合医生治疗即可，大部分患者采取手术后能够成功，一般能得到治疗。
如果是比较轻的肠套叠可以进行保守治疗。如果腹痛症状较轻没有明显的发热表现。可采取手法复位，氧气灌肠的方法，促使肠道套叠的肠管自行分开来治疗肠套叠，这样可以对人的身体伤害稍微小一点。
儿童肠套叠可以通过保守治疗、手术治疗等方式进行治疗。
肠套叠在小孩子身上经常会出现，是较为严重的病症，究其原因，主要是婴儿肠道蠕动不规则，若未就医治疗，也许是严重后果。一般情况下，婴幼儿出现这种状况之后，可以采用手术来对其进行治疗，但是对于患有坏死性肠炎或者其他病症的患儿来说，就不能使用此种方式来进行处理，因为这两种方法都比较危险。医学上以轻症用灌肠为主、充气和其他手法复位，一旦坏死，可需手术取出坏死部分，再行造瘘。