直肠粘膜内脱垂不能够自己好。在早期的时候，可以采取保守治疗，多注意饮食，多吃新鲜的青菜水果，尽量保持大便通畅，可第一防止直肠粘膜脱垂进一步的加重。也可以在指导下采取排粪造影检查。
直肠粘膜出现了脱垂，根据它的轻重程度治疗方法不太一样。早期的时候保守治疗，别拖延时间，如果直肠粘膜脱垂的越久就会越严重，治疗难度就会加大。保守治疗无效的情况下，只能够考虑手术。
直肠粘膜内脱垂常见的是由于便秘导致的，可以通过用药以及手术等方式进行治疗，多吃一些新鲜的水果和蔬菜，避免熬夜，避免食用辛辣刺激性的食物，可以多吃一些香蕉等食物。
不能，若不治愈严重时直肠脱垂在咳嗽、喷嚏、走路、久站或稍一用力即可脱出，脱出后局部有发胀感，也可感到腰骶部胀痛，脱出的黏膜有黏液分泌，黏膜常受刺激可发生充血、水肿、糜烂和溃疡，分泌可夹杂血性黏液，刺激肛周皮肤，可引起瘙痒。
得了直肠粘膜脱垂，如果症状比较轻微，可以通过吃药来治疗。可以吃些益气的药物，这样可以增加盆底肌肉力量，帮助固定直肠。如果症状严重，则需要通过手术来治疗。可以做注射手术，将硬化剂注射到黏膜下层，使直肠黏膜与肌层粘连固定。也可以做切除手术。要用哪种手术方法要由病人与医生商量决定。
直肠脱垂多发生于儿童和中老年女性。儿童直肠脱垂多为黏膜脱垂，通常5岁前可自愈。成人完全性直肠脱垂并不多见，如直肠反复脱出可导致阴部神经损伤产生肛门失禁，并有引发直肠溃疡、出血、狭窄和坏死的危险，需手术治疗。