肛门闭锁是因原肛发育异常、未向内凹入形成肛管，因而直肠与外界不通，又称低位肛门直肠闭锁。可采用肛膜切开术：于会阴肛区凹陷处取前后纵切口十字切口切开肛膜，使肛门内外相通。然后扩肛至能放入示指即可。术后早期即需开始扩肛，直到排便正常为止。
可以根据直肠盲端距肛门皮肤的距离，采取不同的手术方式，如果直肠盲端距肛门皮肤1.5cm以下，可以进行一次性肛门成形术。或尾路肛门成形术，腹腔镜肛门成形术，会阴肛门成形，骶会阴肛门成形，腹会阴肛门成形术等。根据类型选择不同的手术方法。
先天性低位肛门闭锁是小儿常见的直肠肛门发育畸形。以往对于不合并瘘管的肛门闭锁常规采用原位“X”切开，而对于合并皮肤病或外阴瘘者则多采用肛门后切术或V形肛门成形术进行治疗。
治肛门闭锁的费用是1万-3万元。针对孩子的病情进行诊分类治疗。肛门闭锁的治疗费用不能一概而论，首先肛门闭锁的孩子有很多，不同患者的病因、病情及类型是不同的，所以进行的检查项目和治疗方案也不同，费用自然也不能相同。
治疗肛门闭锁手术的费用是1万-3万元。手术的费用与孩子的自身情况有关，比如肛门闭锁的严重程度，位置都会影响价格。最好去正规医院的，这样比较放心，收费方面也比较合理的。
肛门直肠狭窄：对肛门直肠狭窄的新生儿，只需每天做持续扩肛即可。或高位锁肛：一是切开骶尾部和腹部，把直肠盲端拖至会阴做成肛门。先天性肛门闭锁是先天性肛门直肠畸形疾病之一，常见症状有出生后无胎便，或胎便排出延迟，呕吐，腹胀等完全或不完性梗阻表现。
