牙菌斑通过刷牙和使用牙线就可以清除干净的，每天饭后可冲洗口腔，冲走牙缝和表面的食物残渣和牙垢。漱口液因为有药物成分在内，也能高效的杀菌，同样有着洁齿的功效。
牙菌斑的危害是龋病和牙周病，牙菌斑时间一长会形成牙结石，所以要进行洗牙，可每半年到一年一次。平时配合刷牙，用牙线清洁牙与牙之间缝隙。牙菌斑会引发龋病，龋病俗称“虫牙”，这里的“虫”指菌斑中的细菌。牙菌斑牢固地附着在牙面上，细菌摄入唾液中的糖，分解糖产酸，这些酸会破坏牙齿，最终成洞。
牙菌斑严重的可以选择超声波洁牙机洁治，或者手动去除牙菌斑，是口腔内的细菌斑块，不能被刷牙或者漱口去除，牙菌斑粘附于牙面或牙间的软的还没有被口腔唾液钙化的细菌群体，菌斑控制可以通过刷牙去除，刷牙是控制菌斑最有效的方法。
牙菌斑的去除方法有很多种，最常见的方法是通过刷牙去除牙菌斑，刚吃完饭以后如果做菌斑染色，会发现在牙面上大部分都是牙菌斑，但是这些牙菌斑通过刷牙的方法可以完全去除，菌斑染色的部位都可以去除。
先去洗牙，这样才可以去除牙菌斑，其次是注意刷牙，刷牙时间控制在三分钟左右，上牙往下，下牙往上，咬合面上也要刷，这样才能尽可能的干净，另外至少保证早晚两次刷牙，吃完东西及时漱口。