肛门瘙痒的患者在治疗上可以采取清热利湿、活血祛风、止痒的药物帮助治疗，可以选择外洗和药膏，来缓解瘙痒症状；存在虫卵感染引起的，应该考虑是否有蛲虫感染的现象，采取驱虫的药物帮助治疗。
肛门瘙痒是不会自己好的，而且需要吃一些药物来进行治疗，肛门瘙痒早期的表现为仅限于肛门周围皮肤瘙痒，时轻时重，有时刺痛或灼痛，有时如虫行蚁走，有时如蚊咬火烤，有时剧痒难忍，入夜更甚，令人坐卧不安。
肛门瘙痒应如何治疗问题，肛门瘙痒是很多人常有的症状，肛门瘙痒原因有很多，要及时去医院进行检查诊断，针对病因治疗是关键。对于女性来说，如长期不愈，可蔓延到阴囊或阴唇，还可继发感染，危害特别严重。尤其是会阴部前后缝间瘙痒更剧烈，夜间比白天显着，有虫爬、蚁走、火烤感，影响入睡休息。局部皮肤因搔抓出现抓痕、血痂、色素沉着、苔藓样硬化或湿疹样变，还可继发感染。
积极寻找并去除可能的致病因素，外用止痒剂，必要时阻断局部皮下感觉神经。物理疗法可用紫外线、红外线照射肛周患处。注射疗法是目前较为常用的方法，具有操作简单、疗效确切的特点。
发肛门瘙痒症的寄生虫病中最常见的是蛲虫病，瘙痒多在晚间睡眠时加重，这是由于睡眠时肛门括约肌变得松弛，雌性蛲虫爬到肛门外产卵从而引起肛门周围奇痒。此外阴虱、滴虫等也可引起肛门瘙痒，如果是由于细菌感染所引起的肛门瘙痒，注意个人卫生，每天晚上可以用热水清洗，平时多喝些热水症状便会有所减轻。