治疗直肠炎使用的药物大都是一些西药抗生素，这种药物治标不治本，而且长期服用会有副作用。平时也应该注意基本的保健，一日三餐做到定时定量，不过分饥饿、不暴饮暴食，这样有利于肠道消化平衡。
直肠炎的治疗方法包括：一般治疗：适当休息，进清淡、少渣、营养丰富、无刺激性的食物，并做到心情愉快，劳逸结合；药物治疗：药物包括美沙拉嗪、康复新等，修复肠黏膜，缓解出血症状；穴位埋线：可长期刺激穴位，促进血液循环，加快炎症吸收，加速溃疡愈合。那么建议还是要去医院先做一下肠镜检查再进行治疗。
偏直肠炎的治疗首先要养成良好的饮食习惯，少食多餐，清淡为主，多吃些新鲜的水果及蔬菜，少吃辛辣等刺激性食物，并给予药物及药物保留灌肠治疗。也可以用中药，促进肠道黏膜再生修复，提高整体免疫力，从而达到有效治疗的目的。
一般治疗有活动期病变者宜卧床休息，给高热量、易消化、富营养饮食。严重病人应予补液，纠正脱水和电解质平衡失调，静脉高营养疗法或鼻饲要素饮食。也可以手术治疗，手术适应证限于肠穿孔、完全性肠梗阻、下消化道大出血、瘘管及脓肿形成，经内科治疗无效的中毒巨结肠及疑有结肠癌等。
针对病因进行治疗，有与肛瘘、痔疮等其他疾病引起的直肠炎，要及时对相关疾病进行治疗，及时去除诱因。对于血吸虫感染引起的直肠炎进行去除血吸虫治疗。对症治疗，直肠炎会引发一系列的肠胃症状，对于腹泻病人，可以使用止泻药进行止泻治疗。对于直肠过于疼痛病人进行止痛治疗，注射止痛药物等，同时还可以进行中医中药治疗，以达到最大的治疗效果。
直肠炎大多与不良的生活饮食习惯和便秘有关，饮酒刺激也是造成直肠炎的原因之一。应该到正规的公立性医院检查，查清病因，可以在医师指导下合理用药治疗。要清淡饮食，多吃蔬菜和水果，少吃油腻辛辣刺激性食物，少吸烟，少喝酒。
