导致头痛的机理为可剧烈咳嗽、喷嚏、突然用力等诱因，可使胸腔内压和腹腔内压增加，造成静脉回流到右心房受阻，使中心静脉压增加，静脉压力增加传递倒进静脉系统和硬膜外静脉丛，冲击压迫硬脊膜，造成蛛网膜下腔的压力进一步增加，使颅内压增加而引起头痛。
咳嗽背痛可能是由于刺激所引起的，也可能是由于炎症感染所导致的，具体的情况应该到医院进行拍片检查，根据具体的原因选择比较适合的方案，达到治疗的效果。如果咳嗽时有腰痛，考虑到与肺部炎症密切相关，可以到医院进行肺部疾病检查进行诊断。用药可口服抗生素，可联合口服化痰止咳药促进气管排痰。其中，感染引起咳嗽，咳痰易累及胸膜，引起胸膜炎，而胸膜炎患者可引起腰痛，与呼吸有关。缓解疼痛。
咳嗽的时候腹部的肌肉也会跟着用力，如果咳嗽的比较剧烈，腹部的肌肉就会变得比较紧张，会导致短暂性的腹痛。如果有肠道疾病，如肠炎、痢疾、肠道寄生虫等疾病，咳嗽时腹部压力增加会挤压到肠道，进而刺激到病灶部位，引起疼痛。
咳嗽小腹疼痛是因为腹部有压迫感导致。频繁的咳嗽导致腹内压增加，腹部肌肉瞬间的膨胀收缩，从而导致腹部肌肉充血水肿，引起小腹疼痛，需要及时的进行治疗。咳嗽主要是因为咽喉炎、气管炎等，平时要多喝水。如果咳嗽逐渐改善后，仍然存在小腹疼痛的现象，要考虑其他病因，比如肠道寄生虫等疾病，主要是咳嗽期间腹部压力会使肠道受到挤压，病灶一旦受累便容易引起小腹疼痛。
咳嗽尤其是长期剧烈咳嗽可能会伴发肝区疼痛的症状，是因为咳嗽时腹压增大、膈肌上抬及腹部肌肉紧张，长时间的腹肌收缩舒张会引起肌肉疲劳，甚至形成肋间肌肉的拉伤劳损而引起。
如果咳嗽时背部疼痛，需要考虑呼吸系统的炎症。主要是由呼吸系统疾病引起的，比如急性气管支气管炎，肺炎，胸膜炎，气胸，气道异物，肺肿瘤，甚至肺栓塞等。如果出现以上症状，需要到医院做进一步的检查，比如血常规，血沉，结核抗体，CT，肿瘤标志物，凝血五项等。以上结果表明，胸膜增厚，肿瘤标记物升高，常考虑有某些疾病，例如间皮瘤。