新生儿呼吸道感染可以在医生的指导下通过抗病毒和抗感染的药物进行治疗，但具体的用药要根据新生儿呼吸道感染的轻重程度来进行决定。如果新生儿在出现感染以后有发烧的症状，应该通过药物的方式降温，避免身体出现不适的症状，如果发烧的情况不是特别严重，可以通过物理降温的方式进行改善。母亲也可以口服化痰止咳的药物，这样能够通过乳汁改善宝宝出现呼吸道感染的症状。
新生儿肺炎的早期症状主要有呼吸急促、口唇发青等。
新生儿肺炎的早期症状主要就是有呼吸困难的表现或者呼吸节律不均匀、呼吸急促、呼吸频率比较快超过六十次，或者有明显的口唇发青、发绀，有明显的呼吸急促或者上不来气的表现，同时有可能会有明显的呛奶吐奶或者咳嗽的症状。新生儿肺炎是新生儿期比较严重的婴儿疾病，一般新生儿肺炎不是单纯的出现的，有可能会合并一些其他方面的疾病，例如心脏方面的问题，呼吸不通畅或者新生儿脑膜炎，还需要根据孩子的表现以及检查结果进行具体的分析和治疗。
考虑新生儿是吸入性肺炎。一般新生儿轻微肺炎一般会使用抗生素治疗。新生儿肺炎还表现为咳嗽发热等症状。应该针对这一系列病情合理用药。如果是感染发生病变形成病毒性肺炎，还应考虑使用抗病毒素。通过检查确定病因，积极配合医生治疗。
宝宝呼吸道感染的时候，如果仅表现为上呼吸道感染，可以先多喝温水观察2天到3天，如果病情有缓解则继续物理疗法，多喝水，注意休息，清淡饮食，一般一周左右便会痊愈，口服药物。
上呼吸道感染可以使用消炎杀菌的药物进行治疗，上呼吸道感染导致的咳嗽，在临床上是比较多见的。引起的原因与病人抵抗力下降以后，受凉导致的病毒或细菌以及支原体、衣原体等感染有关系。
对于上呼吸道感染引起咳嗽的患者，平时要做到戒烟，保持室内空气的流通，多注意休息，避免受凉再次感冒，同时可以配合药物进行治疗，一般三到五天就可以痊愈。通常情况下，我们可以选择一些止咳药物，如甘草片、清肺化痰止咳颗粒、复方氨溴特罗口服液等；也可以在医生的指导下使用一些消炎的药物，比如阿莫西林，罗红霉素等。