根据患者甲状腺多发胶质囊肿的体积、大小、具体性质和患者是否伴有明显临床症状等因素，往往采取不同的处理方法。具体如下：
1、甲状腺多发胶质囊肿体积相对较小时，囊肿没有压迫局部神经血管或重要脏器。彩超提示囊肿边界清晰，回声均匀，无明显恶性肿瘤征象。可定期进行甲状腺彩超检查，仔细观察囊肿变化情况，暂时无需特殊处理。
2、甲状腺多发胶质囊肿体积大，压迫至患者喉返神经、气管、食管，患者出现一定程度的声嘶、呼吸困难，彩超检查提示囊肿纵横比大于1，且有明显血流信号等恶性肿瘤征象。此时多发性胶质囊肿病情较严重，需及时手术治疗。
甲状腺多发性囊肿是在甲状腺中发现的液体囊肿，肿块大部分呈圆形，大小约2-5cm之间，光滑，一般无疼痛或轻微疼痛，做吞咽动作时可随动作上下移动。
甲状腺囊肿大部分是单发的，但也可能多发。多发囊肿，囊中压力不是很高，质地柔软，液体多，摸起来也硬，感觉很韧。甲状腺囊肿无论是单发还是多发，大部分无症状，除非肿大明显或囊内出血，否则可引起压迫症状。甲状腺颈部有气管、食管、喉头，可引起疼痛、吞咽困难、呼吸困难，甚至声音嘶哑。甲状腺囊肿大部分为良性，无相应压迫症状可定期复查。如有呼吸困难、吞咽困难、声嘶等严重压迫症状，可能需要手术治疗。
较大的囊肿有可能出现压迫的症状，比如说压迫气管，可以出现呼吸困难，如果压迫食管可以造成吞咽困难，如果压迫到喉返神经，可以造成声音嘶哑，压迫喉上神经，可以引起饮水呛咳，部分甲状腺胶质囊肿如果出现了癌变，还会侵犯颈丛，引起剧烈的疼痛，并出现淋巴结的转移。
甲状腺胶质囊肿要紧，甲状腺囊肿是良性肿瘤，小的囊肿没有压迫症状不需要治疗，定期复查，大的囊肿，有压迫症状，如声音嘶哑、呼吸困难、吞咽困难等，需要手术切除，术后要定期查甲状腺功能。
甲状腺胶质囊肿是不严重的，这属于甲状腺的良性病变。如果病人的囊肿比较小，定期复查便可；但是需要注意的是，如果病人甲状腺胶质囊肿比较大，而且出现破裂出血，会造成病人出现颈部的疼痛和压迫症状，影响到病人的日常生活，这时候病人要进行手术切除，通过手术治疗。
可以采用手术治疗，这种多发性疾病多是良性疾病，可以观察，但是这个出现明显的症状，比如吞咽困难，说明肿块已经压迫到食管了，这样的话，就需要手术切除这个囊肿了。在手术之前还要进行一次检查，来制定治疗方案。
