治疗亚急性甲状腺炎主要通过药物治疗，治疗发热、颈部疼痛等症状。体温高于38.5℃时可进行退热处理，如颈部疼痛、耳颞部疼痛等，可加用非甾体类抗炎药进行止痛治疗，但如果单纯使用非甾体类抗炎药无法控制病情时，排除激素使用的禁忌症，可适当加用激素药物的治疗，具体用药需要在医生的指导下进行，不可盲目用药，容易引发不良反应。
若亚急性甲状腺炎症状较轻微，可通过锻炼、饮食等方式，由此获得自愈。
亚急性甲状腺炎属于巨细胞性甲状腺炎的范畴，常继发病毒性上呼吸道感染。由于发病急，所以往往没有明确的诊断方法和治疗措施，在确诊之后会出现一系列严重的并发症，比如高热惊厥，呼吸困难等。若症状较轻微，可通过锻炼、饮食等方式，由此获得自愈。第一，要积极参加体育锻炼，能做运动、跑，可进行太极锻炼，这些锻炼可提高病人免疫能力，从而能够提高病人抗病能力，具有显着抑制亚急性甲状腺炎病症扩大作用。另外应该加强休息，保证充足睡眠，保持心情舒畅，不要过于紧张焦虑，以免导致病情加重。也可注意膳食，食用鲜虾、鸡蛋等优质蛋白，也可多吃含维生素较高水果，忌些高油腻，高脂肪类食品，透过上述的饮食，也有锻炼的机会，亚急性甲状腺炎通常可以自愈。
急性甲状腺炎可以通过药物、手术等方式进行治疗。
急性甲状腺炎的治疗原则是：抗感染和手术介入，在早期确诊后，首先要选择广谱抗生素进行经验治疗，等穿刺物病原体的培养有了效果，再进行抗生素的调整。一般来说，如果合并有一些基本的疾病或者先天性畸形，很难控制感染，需要在2-3个星期内使用抗生素，在脓肿形成后进行抗感染治疗，同时还要进行排脓。
亚急性甲状腺炎症通常可以自愈。
亚甲炎是由于病毒感染所致的甲状腺炎症，临床上没有特别的治疗措施。远期预后良好，复发率极低，每年约2%的复发率。此外，亚急性甲状腺炎是一种自限性疾病，多数患者通常是可以自行痊愈的，但是在某些地方出现的肿胀和不适症状会持续几个月或更久。在康复过程中，需要对病人进行心理治疗，还要保证病人的情绪稳定，并建立起战胜疾病的信心。
亚急性甲状腺炎多导致内分泌系统变化，因此，治疗上以内分泌科居多，但有发烧或全身乏力症状，以及其他某些外科，亦可到普通外科就诊。
亚急性甲状腺炎是一种病毒感染性甲状腺炎症性病变，主要表现为甲状腺疼痛，可伴有发热、乏力、肌肉酸痛等，如果发现了有明显甲状腺肿大或者结节，就需要及时就医检查，以免延误病情而造成更严重的后果。对亚急性甲状腺炎病人来说，平常饮食要颇为讲究，勿食辛辣刺激性食物，也勿饮浓茶。
亚急性甲状腺炎血沉增高可能是患者患有亚急性甲状腺炎或是由病毒引起，具体分析如下。
亚急性甲状腺炎又称巨细胞性甲状腺炎，柯萨奇病毒和腺病毒是导致亚甲状腺炎的主要原因。典型的症状是甲状腺肿大、疼痛等，严重时会出现发热、头疼、乏力、口干等全身症状。主要表现为上呼吸道感染，病毒感染后1-3周。血沉快是甲状腺激素的特点，一般血沉在每小时50毫米以上。
