甲亢眼睛突出在治疗方面，对于缓解甲亢的眼睛突出，效果都不是特别理想，所以要求甲亢的病人在早期就把甲亢病情控制好，这样可以有效减少眼睛突出的发生率。对于活动性眼病，予以激素冲击治疗，也可以球后外照射，但需要联合大剂量激素冲击。
胃肠型常以腹泻为突出症状大便1天数次甚至数十次水样腹泻。无脓血便，常误诊为肠炎，慢性结肠炎。有部分甲亢病人以腹痛为主要症状，呈弥漫性或局限性腹痛，可类似胆绞痛、肾绞痛、溃疡病，胰腺炎，阑尾炎，往往诊断为急腹症而收体外科治疗。
治疗甲亢首先可以服用抗甲状腺药物治疗，据甲功结果调整药物剂量。也可以做放射性碘131治疗，术后需要甲状腺激素补充治疗。对于甲状腺明显肿大，出现压迫症状，中重度甲亢长期服药无效，停药复发或不能坚持服药者，手术治疗是首选。
甲亢的治疗主要有三种方法，抗甲状腺药物、同位素碘131治疗和手术治疗。这三种治疗方法各有其优缺点，应该根据甲亢的病因年龄、甲状腺的大小、甲亢复发史、有无妊娠、有无突眼、有无甲亢性心脏病、对治疗的态度医疗条件等因素综合分析，加以选用。
甲亢是由于自身的免疫损伤引起发病的情况，现在医疗阶段不能采取对因治疗，只能是采取对症治疗。这类药物可能会引起粒细胞减少的情，在医生指导下口服药物配合中医辨证治疗。一般治疗需要一年到两年左右时间的。避免情绪因素的影响，不甲亢治疗可以使用他巴唑、丙基硫氧嘧啶等药物进行治疗。甲亢，是过量的甲状腺激素导致的临床症状。
如果是浸润性突眼，治疗上首先要枕高枕头，也就是要高枕卧位，并限制钠盐的摄入，使用利尿剂可以减轻眼部的水肿，在阳光明媚的日子，可以戴有色眼镜来保护眼睛。如果是单纯性突眼，不需要特殊治疗，突眼会随着甲状腺功能的好转自行治好。
