甲减治疗，要注意患者的剂量要适当降低，有冠心病或其他心脏病病史及精神症状的患者甲状腺素更应该从小剂量入手，且要慢慢增加。
因血清中T3,T4浓度正常值范围大，甲减病人情况有轻有重，生活环境和劳动强度时常发生变化，对于甲状腺素的需要量和敏感性亦不尽一致，因此，在治疗上应注重个体化。
以预防腺垂体功能减退患者的发生，急性肾上腺皮质功能不全的出现，甲状腺素治疗应于皮质激素取代治疗之后进行。
严重，甲状腺功能减退是属于慢性的疾病，一般需要长期的药物治疗来控制病情的稳定，需要定期复查血甲状腺功能的指标，根据指标来调整药物的剂量。一般每月都是需要复查一次。如果长时间不复查，那会有引起血甲状腺功能指标波动的改变。
甲减是一种全身代谢减低综合征，除了少数甲状腺炎引起的一过性甲减可以治愈之外，其他的都是无法治愈的，需要终生服用药物进行治疗，如果不及时治疗，可能会出现疲劳、体重增加、记忆力减退、反应迟钝等症状。
青春期产生的加减，可能会导致青少年的发育受到影响，而成人产生的加减，则可能会影响导致患者的生育力和性欲，女性患者可能会出现月经不调、流产的可能。
如何处理甲减和亚临床，应根据病人具体情况决定。
如亚临床甲减患者，通常无症状，也无体征，常因查体后被人发现，因此，绝大部分亚临床甲减无需处理。对于甲减症患者来说，可以选择药物进行辅助治疗，比如使用左甲腺素钠或者右甲素，这都能够取得较好疗效。但若伴有较严重的甲减症状如乏力、便秘等，且Tsh大于10毫国际单位每升，病人再次合并动脉硬化，血脂异常和甲状腺相关抗体升高的问题，需要处理。因此，亚临床甲减和甲减都应该进行治疗，而不能简单地把二者对立起来。
甲减好了患者一般会瘦的。但根据每位患者的体质与病情不同，所以因人而异。建议患者在治疗甲减的过程中，也要控制好饮食和作息时间，不要熬夜，抽烟喝酒，饮食不规律等现象，要少食多餐，饭后要注意适当的运动。
