急性甲状腺炎可以通过药物、手术等方式进行治疗。
急性甲状腺炎的治疗原则是：抗感染和手术介入，在早期确诊后，首先要选择广谱抗生素进行经验治疗，等穿刺物病原体的培养有了效果，再进行抗生素的调整。一般来说，如果合并有一些基本的疾病或者先天性畸形，很难控制感染，需要在2-3个星期内使用抗生素，在脓肿形成后进行抗感染治疗，同时还要进行排脓。
治疗亚急性甲状腺炎主要通过药物治疗，治疗发热、颈部疼痛等症状。体温高于38.5℃时可进行退热处理，如颈部疼痛、耳颞部疼痛等，可加用非甾体类抗炎药进行止痛治疗，但如果单纯使用非甾体类抗炎药无法控制病情时，排除激素使用的禁忌症，可适当加用激素药物的治疗，具体用药需要在医生的指导下进行，不可盲目用药，容易引发不良反应。
亚急性甲状腺炎等，一般数周或数月后减轻，病程6-12个月，反复发作者甚为罕见。
一旦出现了慢性化过程，则会对患者带来很大的危害，严重时还可导致死亡。如亚急性甲状腺炎反复发作，有可能是糖皮质激素减量过快，停药过早，此症若症状较轻微，可应用非甾体类消炎止疼药，疼痛症状好转即可，如仍伴发热，血沉升高十分明显，可再应用糖皮质激素，以改善症状。对于亚急性甲状腺结节或囊肿者，一般不建议进行治疗。待血沉恢复正常后，再逐步减量，总疗程必须超过6-8周，如停药太快，太早，极易又导致亚急性甲状腺炎的复发。因此对于已经发生了亚急性甲状腺炎的患者，应该尽早进行治疗和护理，避免造成不必要的损失。亚急性甲状腺炎为病毒感染变态反应性炎症，发病前，许多病人都有上呼吸道感染病史。
亚急性甲状腺炎治疗方法应结合患者的具体情况而定，并且患者病情存在个体化的状况，并非所有病人所呈现之症状均一致。
要选择合适的药物来进行辅助治疗，这样才能更好地提高疗效，减少不良反应的发生几率。许多病人就是反应不一样，例如，有些病人颈部疼痛非常明显，部分病人颈部疼痛较轻，但当颈部疼痛显著时或较轻颈部疼痛时均需优先选用非甾体抗炎药进行止疼、消炎治疗，只有当非甾体类抗炎药不能控制病人颈部疼痛的情况时，才能考虑适当增加激素治疗。
急性甲状腺炎是甲状腺的急性化脓性感染，又可以称为急性化脓性甲状腺炎，常见症状为高热，出汗，喉咙痛，吞咽困难等，还会引起甲状腺的局部肿块，皮肤会发红，发热。急性甲状腺炎主要是抗感染治疗，在发病初期，应该选择消炎类药物进行治疗。
亚急性甲状腺炎患者在进行治疗时，需要引起重视，亚急性甲状腺炎可表现为共同症状，分别为发热、甲状腺肿大、颈部疼痛等。这些症状都是由于甲状腺功能失调所致，要针对病人的病症对症下药。
如果亚急性甲状腺机能亢进的患者出现了这些症状，就应该及时到医院检查诊断并给予针对性的药物治疗。以及亚急性甲状腺炎病人，很可能起病时症状较轻微，不需要止疼药之类的对症治疗。而且一些病人很可能在发病时症状更加严重，就是要采取相应的措施。如果没有及时采取针对性的措施，那么病情就容易加重或者导致病情恶化。如将需止疼和减慢心率的对症支持治疗，一旦症状较重时，相应治疗时间亦随之增加。
