多囊肝、多囊肾，治疗上主要以对症治疗为主，比如多囊肝、多囊肾的患者，如果出现了血尿，患者早期卧床休息，合并感染积极的抗感染治疗。如果囊肿过于巨大，而产生了压迫的症状，比如多囊肾出现腰部的疼痛，肝囊肿出现上腹部的疼痛，这时如果有单个的囊肿比较巨大，可以行去顶减压术，来减轻患者的这种疼痛不适。出现了肝功能的异常或者肾功能衰竭，对症的使用保肝类的药物、保肾降糖类的药物对症治疗。
一般来说，妇科多囊病需根据患者的具体情况采取不同的治疗方式，具体如下：
如果患者较为肥胖，治疗多囊病应以帮助患者减重为主，如控制饮食、增加运动量等。对于青春期的多囊患者，可以通过口服达英35、地塞米松等药物进行治疗。如果患者有生育需求，除口服氯米芬外，还可以选择手术治疗。
在日常生活中，患者应当注意健康饮食，多吃新鲜的蔬菜和水果，少吃生冷、辛辣、油腻、刺激的食物。
卵巢呈现东南亚改变是属于内分泌病症现象，主要是由于体内激素水平分泌紊乱，在彩超下会看到双侧卵巢内有很多没有发育成熟的卵泡，每一个切面都会大于十个以上，所以很形象的称谓卵巢多囊。
卵巢多囊症可以药物治疗。药物治疗可以对抗雄激素的作用，促使卵巢排卵。也可以腹腔镜手术治疗。在腹腔镜下，手术穿刺卵泡，使雄激素水平下降，从而达到治疗目的。治疗后可以做个卵泡监测，如果有正常的排卵就是治好了。
目前治疗多囊卵巢综合征的技术比较成熟，是可以治好的，一般的可以服用药物来治好，也可以选用手术的方法来治疗，手术治疗效果比较好。腹腔镜下卵巢电灼或激光打孔治疗（LOD）：目前首选的外科手术治疗方法是应用热穿透或激光进行腹腔镜卵巢打孔术，术后促排卵治疗反应改善。
