疱疹性咽峡炎临床表现常有高热，体温达到40度以上，咽痛，软腭及颊粘膜处可见小的淡红色滤泡，局部破溃后，疼痛加重。一般多见于儿童，因为是病毒感染，有自愈性，急性期主要是控制体温，38.5度以下可以用温水擦拭手心，脚心。
疱疹性咽峡炎常见于小儿，患儿常表现为高热、惊厥、烦躁不安等症状，成人往往主诉咽痛、咽部不适、发烧等症状。由于患儿言语表达欠佳，往往表现为哭闹，对患儿进行查体时，往往会发现咽峡部有少量或多个点状或疱疹样改变，一般采取对症支持治疗。
大人患了疱疹性咽峡炎的主要症状表现在皮肤黏膜上，在病症发作的初期，多数会出现咽部充血，散落在灰白色的小疱疹上，有1-2毫米大小，而且它的周围会由于充血而发红，在2-3天之内逐渐扩大。此外，有些可能出现急性淋巴性咽峡炎，是黄白色的丘疹，周围有红晕的症状。此外还会出现一些其他的症状，例如持续高热或反复高热、咽喉疼痛、腹痛。
疱疹性咽峡炎症状有很多，在起病时会出现高热、咽喉肿痛以及流诞等症状，并且在随着病情持续加重后，会导致厌食、情绪烦躁、吞咽障碍、精神萎靡等表现，所以在发病期间会导致身体出现明显的不适。
主要表现是发热、鼻塞、流涕、咳嗽、食欲不振，可能还会伴有呕吐、腹泻等症状。查体一般可以在咽峡部看到疱疹。疱疹的主要形态是小的、圆形的，局部周围有红晕，发热是以高热为主。
疱疹性咽峡炎常见于小儿，患儿常表现为高热、惊厥、烦躁不安等症状，成人往往主诉咽痛、咽部不适、发烧等症状。由于患儿言语表达欠佳，往往表现为哭闹，对患儿进行查体时，往往会发现咽峡部有少量或多个点状或疱疹样改变。
