疱疹性咽峡炎临床表现常有高热，体温达到40度以上，咽痛，软腭及颊粘膜处可见小的淡红色滤泡，局部破溃后，疼痛加重。一般多见于儿童，因为是病毒感染，有自愈性，急性期主要是控制体温，38.5度以下可以用温水擦拭手心，脚心。
疱疹性咽峡炎主要的症状是咽部疼痛、吞咽困难，有的会伴有高热的情况。在疱疹期间，如果出现持续发烧的情况，患者首先可以采用物理降温的办法，可以用温毛巾擦拭身体，同时也可以用冰袋冷敷额头、双侧颈部。在此期间患者一定要多喝水，必要的时候，退热药治疗。
疱疹性咽峡炎常见于小儿，患儿常表现为高热、惊厥、烦躁不安等症状，成人往往主诉咽痛、咽部不适、发烧等症状。由于患儿言语表达欠佳，往往表现为哭闹，对患儿进行查体时，往往会发现咽峡部有少量或多个点状或疱疹样改变。
大人患了疱疹性咽峡炎的主要症状表现在皮肤黏膜上，在病症发作的初期，多数会出现咽部充血，散落在灰白色的小疱疹上，有1-2毫米大小，而且它的周围会由于充血而发红，在2-3天之内逐渐扩大。此外，有些可能出现急性淋巴性咽峡炎，是黄白色的丘疹，周围有红晕的症状。此外还会出现一些其他的症状，例如持续高热或反复高热、咽喉疼痛、腹痛。
一般来说，小儿疱疹性咽峡炎的治疗方法有日常调理、药物治疗等。
小儿疱疹性咽峡炎通常是肠道病毒感染引起的，主要表现是高热、拒食、口水增多等。家长给孩子适量吃流质饮食，并注意食物的温度不宜过高，避免刺激破溃的口腔粘膜；并遵医嘱给孩子口服蒲地兰、蓝芩口服液，如果孩子出现持续高热不退、精神萎靡的症状，则需要输液治疗，避免病情加重。
疱疹性咽峡炎发热时，给予退热药物治疗。无特效抗病毒药物治疗，该疾病是自愈性疾病，如无继发细菌感染，也无并发症，在4-6天会自愈，严重者也会在两周自愈。多喝水，给流质，易消化，富营养饮食。
