两者可以联合使用，但是不要同时吃，一起吃的话会有影响小檗碱效果。因为药物之间可能有相互的作用，服用两种以及两种以上的药物时候，最好可以间隔一个小时吃药的。
通常来说，整肠生和蒙脱石散可以一起吃，具体分析如下：
整肠生和蒙脱石散是调节肠道菌群的药物，而蒙脱石散具有良好的止泻效果。如果是因为肠道菌群失调导致的腹痛、腹泻等情况，建议同时服用。但是，整肠生与一些胃药有一定的药物不良反应，比如导致胃胀、胃疼等。因此，需要患者在医生的指导下，选择适当的药物进行治疗。
蒙脱石散和黄连素区别如下：
1、治疗机制：蒙脱石散是通过吸附病毒和细菌的方式来实现治疗目的，主要用于治疗腹泻；黄连素是通过抗菌消炎来实现治疗腹泻的目的，大多用来治疗细菌性痢疾、细菌性肠道感染。
2、副作用：便秘是蒙脱石散的副作用；恶心、呕吐、皮疹等症状是黄连素的副作用。
出现腹泻症状的患者，建议可以在医生的指导下，选择适合自己的药物进行治疗。
蒙脱石散和黄连素区别如下：
蒙脱石散是通过吸附病毒和细菌的方式来实现治疗目的的，主要用于治疗腹泻；黄连素是通过抗菌消炎来实现治疗腹泻的目的的，大多用来治疗细菌性痢疾、细菌性肠道感染。出现腹泻症状的患者，建议可以在医生的指导下，选择适合自己的药物进行治疗。日常生活中，腹泻的患者应注意多休息，保持心态平和，不要有太大的精神压力，还要注意个人饮食，保证营养均衡，有利于身体恢复。
一般情况下，蒙脱石散和黄连素对于痢疾有一定的疗效，但蒙脱石散是一种辅助疗法，它通过吸收肠道中的病菌和病毒来清除体内的病菌和病毒，起到止泻的效果。而黄连具有一定的抗菌功效，当出现急性肠炎后，可能会出现腹痛、发烧等症状，可以服用黄连素，配合蒙脱石散进行治疗，可以起到抗菌消炎的作用，有较好的治疗效果，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，以免对身体造成不良影响。
这两种药物是可以在一天内服用的，但是服药顺序有先有后，如果患者确实有些应的症状，是可以在医师指导下，服用这两种药物的。尽量先口服蒙脱石散或者是饭前，或者是空腹进行服用，然后再应用藿香正气水口服。
