最为常见的病因是直肠内异物损伤。未消化的骨片、木片或其他带有锐利角的各种异物可直接损伤直肠黏膜而发生直肠炎。此外，严重便秘时的坚硬粪块，可引起直肠炎甚或溃疡。重金属（汞、砷等）中毒或者发生以胃肠道损伤为主要特征的传染病时，常常并发直肠炎。
造成直肠炎的原因有慢性炎症的刺激：长期的慢性炎症可能是引起肛门直肠炎的要素。如慢性细菌感染、阿米巴痢疾、慢性非特异性结肠炎、憩室炎等，使得粘膜发生肉芽肿、炎性变和假息肉阶段而发生炎变。
小儿肠炎多由病毒、细菌、寄生虫感染引起，主要症状有腹泻、呕吐、食欲低下，病情严重的患儿因大量吐泻而脱水，电解质紊乱，伴全身中毒症状，具体表现为皮肤干瘪，眼眶凹陷，发热不退，尿少，甚则危及生命。
长期的慢性炎症可能是引起肛门直肠炎的要素。如慢性细菌感染、慢性非特异性结肠炎等，使得粘膜发生肉芽肿、炎性变和假息肉阶段而发生炎变。此外，痔疮、肛瘘、肛裂、毛囊炎等长期刺激肛门皮肤，也可引起炎变。饮食不慎、过度饮酒、过食刺激性强的食物等，不适当的长期服用泻药，肛门内腐蚀性药物过多，细菌感染均可引起直肠炎。
造成直肠炎的原因有，慢性炎症的刺激：长期的慢性炎症可能是引起肛门直肠炎的要素。如慢性细菌感染、阿米巴痢疾、慢性非特异性结肠炎、憩室炎等，使得粘膜发生肉芽肿、炎性变和假息肉阶段而发生炎变。
