宝宝生理性腹泻可通过以下方式进行处理。
儿童乳糖不耐受、受凉或进食过多可能会引起宝宝生理性腹泻，如果宝宝的症状较轻，则建议适当补充锌剂、微量元素；如果宝宝症状比较严重，建议家长在医生的指导下给患儿服用一些胃肠黏膜保护剂或调节肠道菌群的药物进行治疗。
注意病情好转后家长也不能放松警惕，要注意早晨起床后，及时打开窗户，呼吸室外新鲜空气，同时保持室内空气流通。
宝宝生理性腹泻1-3个月左右能好。
生理性腹泻以6个月内婴儿多见，外表虚胖，常伴湿疹并在出生后很快发生腹泻，除了大便次数的增加，未见其异常症状，食欲良好，对它的生长发育没有影响，通常1-3个月左右能好。如果是感染性疾病引起的腹泻，可表现为发热、腹痛和呕吐等症。
此外，腹泻症状渐渐改善，可给予婴儿口服益生菌，以调整胃肠功能。
早期的主要症状是呕吐、体温在38℃~39℃之间，继而出现腹泻，每天大便在10次左右，个别孩子可达20次。早期可有粪便，经数次腹泻后，大便呈水样或稀米汤样，无脓血且量较多。由于患儿大量失水，很快发生脱水现象，出现精神萎靡，表情淡漠，嗜睡，面色灰白，前囱门和眼窝下陷，皮肤松弛，捏起后不能立即展平，尿少，口脏黏膜干燥等症状，若不及时纠正脱水状态，常可导致死亡。
一般情况下，宝宝生理性腹泻可能是生理性的痢疾是一种婴儿在出生后会有的，一般小孩在2-3个月以后，就会有排便。年龄较轻的儿童，在一个多月的时间里，大便不成形。随着肠胃的恢复，宝宝的排便也会慢慢成型，但如果是生理上的腹泻，则会一天一次的拉稀，一次就是三五次。这种孩子能吃能喝能长肉，身体会比较虚胖，但是不会对孩子的发育造成任何的负面影响。儿童大多有家庭病史，由于对身体的生长发育没有很大的负面作用，所以不需要过多的处理。4个月以后，如果补充更多的食物，就会改善。由于母乳中含有乳糖酶，引起的乳糖不耐受，从而引起了宝宝的痢疾，如果减少喂奶量或者使用思密达，就可以减轻。不建议使用市场上的任何一种。
通常情况下，生理性腹泻主要发生在6个月以内的婴幼儿，一般都是纯母乳哺育，这种宝宝外表肥胖，经常会出现湿疹。新生儿出生后会出现腹泻，大便可以是稀便，没有粘液脓血，一天几次到十次，不会有发热、呕吐、腹胀等表现。
婴儿的精神状态良好，进食良好，体重增长平稳，不会对身体的发育造成一定的影响，主要是因为乳糖不耐受。如果孩子在吃了辅食或者换成了腹泻的奶粉后出现了明显的改善，那么就有可能是生理性的腹泻。需要注意的是臀部的保养，避免出现红色的臀部。
生理性腹泻是由母乳原因造成的，解决的根本办法就是换奶，药物治疗是不能解决根本问题的，当改吃牛奶或其他乳品后一般都能奏效，对于生理性腹泻婴儿应加强护理，应及时换尿布，用温水清洗臀部及会阴部，并用软膏涂抹，否则就有可能引起臀部皮肤发红，甚至局部感染。