要进行全身抗炎治疗，建议口服头孢类抗生素，加甲硝唑类药物，可以控制炎症，局部消毒以后把脓肿切开引流。引出脓肿内的脓汁，这样可以明显缓解疼痛，还使得炎症得到进一步的控制。
主要是由于智齿冠周炎而导致的，由于颌骨的退化和牙齿退化不成比例，往往导致第三磨牙萌出位置不足而出现阻生，阻生的牙齿刺激周围的牙周组织产生炎症，称为智齿冠周炎。口服奥硝唑头孢和洛索洛芬钠改善缓解症状。
牙龈脓肿是牙龈组织的局限性化脓性炎症，一般它是牙周炎的一个并发症。治疗时首先要积极治疗原发病，对牙周炎进行系统治疗，同时对牙龈脓肿进行局部的切开、排脓、引流，还要加强口腔卫生，用口腔含漱液，饮食要避免刺激性饮食，戒烟戒酒减少局部刺激。如果是牙齿的原因造成的对牙齿要进行治疗，多发性的牙龈脓肿也可能出现全身反应，如发热等，要配合全身治疗。
小孩肛周脓肿建议及时就诊，通过抗感染进行治疗。
小孩的肛周脓肿如果发病时间比较短，还没有形成明确的脓腔，这种情况下一定要积极的就诊，通过抗感染治疗，因为小孩一般不使用药物治疗，所以建议静脉输注抗生素，或肛周脓肿表面涂抹抗生素。如果小孩的肛周脓肿已经明确形成脓腔，建议积极的手术治疗。一般可以做肛周脓肿切开引流术。
牙龈脓肿要进行全身抗炎治疗，可以控制炎症。还要到口腔科进行局部消毒以后把脓肿切开引流。引出脓肿内的脓汁，这样可以明显缓解疼痛，还使得炎症得到进一步的控制。