从1943年发现自闭症直至1970年一种理论比较流行：冰箱妈妈，就说这个妈妈像冰箱一样，虽然有东西吃，但是冰冷的，对孩子的教育是冷漠刻板的把孩子患上自闭症当作是父母教育不当或冷漠的结果。事实上从20世纪70年代末到80年代初的时候，这个理论就被彻底推翻了。自闭症主要是一个先天性的疾病，跟遗传和基因、基因表达异常存在很大关系。
自闭症可能是由生理因素形成，如神经机能发展，生化机能发展，遗传因素或脑部受损所致。妇女怀孕期间可能因德国麻疹或风疹，使胎儿的脑部发育受损而导致自闭症。新陈代谢疾病亦会造成脑细胞功能失调，影响脑神经传递信息的功能，因而造成自闭症。还有，在怀孕期间窘迫性流产等因素而造成婴儿大脑发育不全，早产，难产，新生儿脑部受伤，以及在婴儿期患上脑炎，脑膜炎等疾病造成脑部伤害，都可能会增加罹患自闭症的机会。
自闭症是有很大几率遗传的。父亲的基因会占很大一部分原因。尤其是生育时间太晚的男性或者是男性的基因出现了突变的情况，在有了孩子以后，这种基因就会使孩子出现自闭症的倾向，所以现在结婚以后一定要优生优育，才能够使孩子更加的健康。
孤独症通常发生在儿童中，其诱发要素与通常遗传、分娩期、免疫、环境等要素有关，特别是与环境要素的影响以及儿童童年的成长经验有关。孩子引起自闭症，是因为小时候的不幸经验，或者受到了这种类型的伤害。教育和训练是治疗自闭症的方法，问题很严重，但是可以改善。
有自闭症可以心理治疗：心理辅导在自闭症的治疗中是极其重要的，要注意帮降低自卑和孤僻心理，增强本病的信心和愿望；严禁打骂患儿，避免责备埋怨，积极鼓励和谈心沟通是较有效的方法。药物治疗：西药虽然见效快，但副作用大，很容易使孩子导致营养不良而影响骨骼的发育，停药后可能导致复发，长期服，会使对药物产生依赖。而中药则见效慢，治疗周期长，并且药物口感不好会导致孩子难以配合治疗。