儿童如果只是在睡眠中咳嗽，很有可能是因为胃食管反流症或过敏性咳嗽。胃食管反流的症状有：睡觉前不要吃太饱，枕头稍微抬高，可以口服一些促进胃肠功能的药物，比如吗丁啉，尽量少吃。过敏性咳嗽要做好过敏原的检查。另外，还应该对鼻咽部进行检查，看看是否有扁桃体增大，以及腺样体是否有肥大。找出病因，再进行进一步的治疗。
需要先让宝宝选择合适的睡姿，减轻呼吸道的刺激。重点是带孩子到医院检查嗓子，化验一下血象看是否存在细菌感染，再对症治疗。建议多喝些温开水，注意保暖，避免受凉，要睡足觉，喝足水，多吃蔬菜和水果，饮食要易于消化且富有营养，应以清淡为主，避免油腻、辛辣刺激等食物。
宝宝咳嗽厉害，应进一步检查，如有炎症或肺炎，应使用抗生素治疗。给宝宝穿护肚子的连体衣，注意宝宝腹部的保暖预防着凉，使用加湿器增加空气湿度，避免空气干燥及过敏性咳嗽。
可以到医院让医生进行肺部的听诊，看有无支气管炎或者肺炎的发生，必要时做肺部的X线片。如果是有支气管炎或者肺炎，需要立即住院治疗。一般轻度不频繁的咳嗽有助于排痰，痰液排出后咳嗽会自然缓解，剧烈而频繁的咳嗽，对身体十分有害，对剧烈干咳，可在短时间内应用止咳药物帮助止咳。
出现咳嗽时，可以选择使用特布他林、沙丁胺醇、布地奈德、丙酸倍氯米松等药物。如果咳嗽没有痰，影响睡眠，可以服用中枢性镇咳药物。所以要确定咳嗽的原因，比如感染导致的咳嗽，需要做血常规、c反应蛋白、呼吸道病原体等检查，然后再根据具体情况进行治疗。如有异物吸入史，应做气管镜或胸部X线检查，异物应在气管镜下取出。
应该带宝宝去医院儿科就诊，并且请医生检查咽喉部或者做血常规、支原体、拍胸片等检查，确定导致咳嗽厉害的病因以后，选择消炎、化痰止咳、抗病毒等药物口服用药或者输液治疗。要多给宝宝喝点水，也可以吃冰糖煮梨。
