新生儿母乳喂养拉肚子可以通过一般治疗、药物治疗等方式进行治疗。
新生儿母乳喂养腹泻，通常多因母体饮食不当引起。母乳中含有大量的维生素和蛋白质以及微量元素，这些营养物质都是对宝宝健康非常重要的成分。因此，母乳喂养过程中，妈妈要特别注意饮食，不能随意食用，不然肯定会造成儿童消化功能紊乱，继而发生腹泻。因此在母乳充足时，就应该尽量保证孩子摄入足够的食物，这样才能有效预防婴儿拉肚子。症状严重者，可让宝宝吃妈咪爱或益生菌调理肠胃，那么，平时就应该让孩子喝更多的水，帮助减轻患儿疾病。
母乳喂养的宝宝拉肚子的情况，可能是由于着凉的情况导致的，或者是母乳出现了问题。在这段时间内给宝宝注意腹部的保暖，尽量避免着凉。然后平时一定要注意饮食安全，多喝水。
拉肚子通常指腹泻。一般情况下，两个月宝宝腹泻可以通过增加饮水量、按摩等方式进行日常护理，具体内容如下：
两个月的宝宝通常体质较差，胃肠道可能比较脆弱，容易受到刺激，而出现腹泻的情况。但由于宝宝的年龄较小，通常不适合使用药物，因此，可以通过日常护理的方式来改善宝宝腹泻的情况。家长可以适当地增加宝宝的饮水量，以免宝宝出现脱水的情况；此外，家长要可以轻轻地按摩宝宝的腹部，也可以适当地按摩刺激穴位，以缓解宝宝的不适症状，改善腹泻的情况。
宝宝吃母乳出现拉肚子，即母乳性腹泻，原因在于母乳，而影响母乳的因素主要在于妈妈的饮食结构。当宝宝吃母乳腹泻时，妈妈调整饮食时关键，要求以清淡、容易消化的食物为主。回避油腻、辛辣及寒凉性食物。如果宝宝大便有粘液脓血等情况，需要做便常规检查。
宝宝拉肚子是婴幼儿最常见的胃肠道疾病。宝宝拉肚子的根本原因是免疫功能差，对病毒细菌的抵抗力弱，当肠道受到感染时，便很容易感染拉肚子。要适当短期禁食，一般不超过8小时。也要适当补液，也要少食多餐，必要时也可以让宝宝服胖得生。
三个月宝宝吃纯母乳拉肚子需要观察排便形状来判断，如果大便成形度比较好，可以暂时不用处理，如果不成型，可以口服一些药物治疗。平时要注意宝宝腹部的保暖，要控制宝宝饮食的频率和卫生。