通常情况下，肾结石手术后肾疼可能是感染导致的。具体情况分析如下：
肾结石患者做了肾结石手术后，如果护理不当容易被病菌感染，进而出现红肿、疼痛等情况，因此肾结石手术后肾疼可能是感染导致的。患者可以按照医嘱使用有抗感染、消炎等作用的药物进行治疗，比如注射用头孢他啶、注射用青霉素钠、罗红霉素胶囊等。日常生活中，患者应注意休息，多喝温水，避免劳累，应注意保持患处皮肤的肤清洁、干燥，以免因感染导致病情加重。
肾结石碎石后，结石再通过输尿管和膀胱，尿道的途中，会出现疼痛的症状，这是正常的，但是如果疼痛比较严重，需要及早到医院进行复查，观察结石是否出现了钱盾没有排出体外出现疼痛。
肾结石碎石后疼的时间是不确定的，因为有结石下来会刺激尿道会出现尿血或是疼痛感的。当输尿管中的结石全部排出时，或者当小结石不足以阻塞输尿管时，疼痛不会发生。勤排尿有助于碎石的排出。
肾结石，碎石后出现疼痛，是正常的碎石后现象，如果持续疼痛难忍可以到医院注射黄体酮或者是使用止疼药物进行治疗，同时多喝水加速排泄。对于肾结石碎石后痛多久目前来说没有一个规律。
一般情况下，肾结石术后拔除输尿管放置的双J管的疼痛是可以忍受的，不能忍受的患者可按无痛胃镜的麻醉进行处理。具体分析如下：
肾结石是泌尿科常见的疾病，肾结石术后，由于会引起输尿管局部的充血水肿，因此术后会常规留置双J管。取双J管一般在门诊进行处理，不需住院。应用膀胱镜或输尿管镜取，粘膜表面局麻进行，一般都可以耐受，若病人恐惧拔管，还可按无痛胃镜的麻醉进行处理。输尿管结石手术后取双J管因男女性别不同也略有差异，女性基本不痛，男性略痛，均可忍受。