术后可能会出现一些并发症，也叫做后遗症。常见的后遗症为缺损的残余瘘以及纠正矫形并不完全造成的心衰，甚至会出现在手术过程中，低血压灌注造成脑部的缺血缺氧，从而使病人成为植物人的状态。这些都是手术的后遗症。
通常来说，难以确定做过先天性心脏病手术的人能活多久，这存在比较大个体差异性。
先天性心脏病患者的生存期取决于患者的先天心脏病的严重性，比如房隔缺损，室间隔缺损，动脉导管未闭等，术后可以延长生存期，其生命周期与正常人相仿。而在进行过先天性心脏病手术后，患者能活多久，一般没有具体数据，与病情的轻重以及预后效果等都存在关系，个体差异性比较大。复杂的先天性心脏病，术后的死亡率要高于轻度的先天性心脏病，长期生存的几率要小，而对于新生儿，一旦手术完成，可以生存数十年。
一般情况下，先天性心脏病和高血压是两种不同疾病，并不会导致对方出现。具体内容如下：
先天性心脏病是出生前的胚胎发育过程中出现了畸形，高血压是出生后肾素－血管紧张素－醛固酮系统激活等因素造成。二者是不同的疾病，先天性心脏病一般不会导致高血压的发生，但是如果患者的生活习惯不佳，也有可能会患上高血压，希望患者养成健康良好的生活习惯。
先天性心脏病种类繁多，是常见的室间隔缺损、房间隔缺损。缺损面积小的人，例如5毫米以下的人可以自主恢复。确实，如果面积大于5毫米的人，就可以进行手术治疗，所以不必太担心，但是缺损面积大的人。影响患儿智力发育，有可能反复出现肺炎。
先天性心脏病做完手术不会复发。
先天性心脏疾病大部分情况下是结构性的异常，都会选择缝合或者修复。有些先天心脏病患者可以在一定程度上自行康复。如果不能自行恢复，可以在一定的年纪做外科手术，通过手术治疗能够恢复心脏正常的生理结构。术后要加强运动，加强免疫力，以免加重心脏的负荷，多吃高蛋白、维生素含量高的食品。
一般情况下，先天性心脏病术后不宜做任何激烈的活动。先天性心脏病术后进行剧烈的运动，会引起体内的血液流通的紧张，从而增加心脏的负荷，从而影响到外科手术修复的修复。所以日常生活中要多做一些调整，避免过度的运动，避免过度疲劳，也不能着凉，要保持良好的心情，吃一些容易消化的食物。术后需要做好心脏彩超检查，以了解术后补伤口的恢复状况。