肉芽肿性前列腺炎治疗包括药物、局部理疗和手术等。有局部或全身感染症状及继发于特异性感染的肉芽肿性前列腺炎，需抗感染治疗，疗程一般为2～4周。根据不同病因，应用抗生素、抗组织胺、抗结核、类固醇激素及免疫抑制剂等药物。
肉芽肿性前列腺炎发病与局部强烈的异物反应有关。前列腺导管阻塞是首要因素，原因包括细菌感染引发的炎症过程或外科创伤造成的组织坏死，前列腺增生也可能造成或加重前列腺导管的梗阻。感染和炎症破坏导管和腺体上皮，细胞碎片、细菌毒素和前列腺分泌物进入组织间隙，成为基质内异物，激发肉芽肿性炎症反应。
肉芽肿性前列腺炎是一种非特异性的、多种组织模式的炎症。与局部强烈的异物反应有关。引起的首要因素是前列腺导管阻塞，包括细菌感染引发的炎症过程或外科创伤造成的组织坏死，前列腺增生也造成或加重前列腺导管的梗阻。
肉芽肿性前列腺炎主要是以下原因引起的：
1、泌尿道反复感染：泌尿道反复感染，造成炎症反应，造成导管阻塞。床上，约70%的患者都有过泌尿系统的感染。
2、医源性泌尿系统损害：前列腺炎多发生于术后半年，经尿道部分切除、前列腺穿刺活检、膀胱肿、卡介苗灌流等。
3有明显的全身症状，常见的致病微生物有真菌、结核杆菌、布氏克鲁斯菌、梅毒螺旋体等。
4、系统性疾病：全身性肉芽肿病的病人，身体的各个器官都会出现肉芽肿性结节，一旦上皮细胞受损，就会有细菌毒素和前列腺分泌物进入人体，从而引发前列腺炎症，从而形成肉芽肿性结节。
独身或长期禁欲者，前列腺分泌液大量积聚，性生活时经常中断性交，强行压抑不射精。使分泌物淤积和充血。大量饮酒，吃酸辣等刺激性食物，可使盆腔和前列腺充血。受潮、受凉、长期坐位，感冒等，都可引起前列腺充血。
肉芽肿性前列腺炎的发病与局部强烈的异物反应有关。前列腺导管阻塞是首要因素，包括细菌感染引发的炎症过程，或外科创伤造成的组织坏死，前列腺增生，也可能造成或加重前列腺导管的梗阻。