巧克力囊肿的症状主要是月经量多、痛经、腹部包块，尤其是会出现性前时疼痛出血，手术治疗是好的治疗方式，药物只是可以抑制，并不能彻底的解决问题，对于巧克力囊肿，如何治疗要听医嘱，要根据个人的身体状况。
初期巧克力囊肿能治疗。巧克力囊肿，是因为子宫内膜异位到了卵巢，子宫在卵巢规律的增生脱落，慢慢形成的黑褐色块状物，颜色类似巧克力。需要到正规医院接受科学检查，明确病因，对症治疗。初期的巧克力囊肿可以采用药物治疗，也可以通过中药调理，帮助卵巢恢复正常的排卵。
卵巢巧克力囊肿症状主要是小腹不适，小腹疼痛，有一个坚实而无痛的肿快；白带异常，色黄异味；月经失常；有时性生活会疼痛；由于会影响卵巢分泌的激素，导致激素的含量变化，导致女性毛体增多以及引导不规则的流血!还有很多换则得了卵巢巧克力囊肿的症状是有尿频和排尿困难，有频繁出血的现象，如果是继续恶化的就会更加危险。但也有少数人无任何症状表现。
卵巢巧克力囊肿是可以通过微创手术治疗，治疗后还是可以正常怀孕生子的。不过巧克力囊肿极易引起复发，如果是手术切除，还是应该要注意健康饮食，少吃含有雌激素的食物，比如豆制品，木瓜，滋补品等，定期复查。
本病是子宫内膜异位症的一种病变。虽然是良性疾病，却有增生、浸润、转移及复发等恶性行为。可采用药物、手术治疗。迄今为止，除手术外，尚无一种理想的治疗方法。注意休息和个人卫生，忌烟酒辛辣凉性食物，热敷疼痛部位，用些排瘀消瘤的药物保守治疗观察，定期复查。
巧克力囊肿会出现痛经，痛经是巧克力囊肿最主要的症状；出现月经不调的症状；同房时发生疼痛感觉；会导致不孕症的发生；发生腹膜炎症。及时的到医院进行检查，可以把身体的病情降低到最低，危害性降到最低。
