首先是肾盂结石，治疗方法包括体外冲击波碎石、经皮肾镜超声碎石取石术等。其次是输尿管结石，治疗方法有体外冲击波碎石等。最后是膀胱结石，可以行经尿道膀胱结石激光或气压弹道碎石取石手术。
尿结石最典型的症状就是疼痛、血尿、恶心、呕吐以及膀胱刺激征。根据不同部位的结石，疼痛的性质不一样，有可能是钝痛，也可能是绞榨样疼。目前治疗肾结石、输尿管结石的措施有非手术治疗以及手术治疗。较小的结石，比如＜0.6cm，可采取解除疼痛以及促进结石排出的药物进行非手术治疗，如果＜0.4cm的结石，绝大部分能够自行排出。对于较大的结石，根据结石不同的部位，治疗结石的手术方法也不相同。
对于输尿管结石的治疗原则是小于5毫米的不需要特殊治疗，可以自己排出；大于5毫米小于2厘米的可以做体外碎石治疗。大于2厘米的需要手术治疗。患者可以根据超声显示的结石大小进行治疗。同时多喝水，应用消炎药预防感染。
尿结石的排出主要通过非手术和手术治疗两种方法。非手术疗法包括大量饮水，保持每天尿量在2000毫升以上，使用药物松弛输尿管平滑肌，适当的运动可以促进结石排出。伴有结水、梗阻、感染等并发症的患者则需要手术治疗。
肾及输尿管结石的治疗要根据结石大小、部位、数目、形状、一侧或两侧，有无尿流梗阻、伴发感染、肾功能受损程度、全身情况以及治疗条件等进行具体分析，全面考虑。但当绞痛发作时，首先应该使症状缓解，而后再选择治疗方案。非手术治疗方法有大量饮水，中草药治疗，针刺，经常作跳跃活动。或者体外冲击波碎石。结石引起尿流梗阻已影响肾功能、或经非手术疗法无效，无体外冲击波碎石条件者，应考虑手术治疗。
