心理性功能障碍可以通过心理治疗、药物治疗等方式进行治疗。
对于心理性功能障碍，处理仍以心理处理为主，由于这种心理性功能障碍，常无器质性之病灶，对心理性性功能障碍实施心理性治疗是行之有效的说法，通常都能达到较理想的结果。对于这类疾病，如果患者自身患有其他方面的问题的话，也可能会造成心理性功能障碍因素。以心理性性功能障碍为目标，常常还要有性心理专家和患者交流，了解患者发生性功能障碍的主要因素是什么，进而有针对性地加以处理。如果病人出现了性功能问题，就会影响到正常生活，而且还会对患者本身产生一定的负面影响，所以要及时进行心理咨询。对于这类患者，一边心理治疗，也可协助某些药物治疗，同时对于此类患者，也常需其性伴侣，同时以患者为治疗对象，对患者给予激励，使患者信心百倍，进而使患者的性功能逐步恢复正常。
通常情况下，性功能障碍患者心理治疗效果不错。
有针对性功能障碍的病人，一般都是因为心理因素导致的性功能障碍，这些病人一般都是没有器质性病变的。所以有针对性功能障碍的病人，如果是心理原因引起的，一定要接受正规的心理治疗。针对这部分患者，往往是因为性经验不多，性技能不强，或者性经历过失败，心理上会产生一些负面的情绪和压力，从而导致患者出现勃起功能障碍、早泄等性功能障碍，及时进行正规的性心理治疗。
根据每个病人的情况不同，会采取不同的治疗方法。从医疗角度的方法会有手术治疗，还有一些心理治疗，还有性教育，是出于现在对性问题的一个顾虑和担忧，所以要纠正错误的观念才能够使夫妻间的生活变得更加和谐。还会有物理治疗，如用电动的按摩器刺激男性的生殖器官。
性功能障碍调养应该选择服用中成药治疗的。治疗时间不要喝酒，也不要吃辣椒等食物，避免影响药效。如果是出现。勃起功能障碍严重的应该。应该暂时避免过性生活，配合服用西药治疗效果更好。
心理原因的性功能障碍的人需要心理专家帮助疏导，要学会调节心理状态，不要有太大的心理压力。放松心情，多参加户外活动，转移注意力，在饮食上要吃富含蛋白质的食物，可提供人产生精子所需用要的各种氨基酸。鸡、鸭、鱼、瘦肉、蛋类，有利于提高性欲及精液、精子的生成。
性功能障碍的治疗需要采取综合方法，器质性疾病要积极治疗原发病。加强性知识指导，消除对性问题的顾虑和恐惧，纠正错误性观念及性交方法，使夫妻性生活协调。心理治疗强调个体化治疗方案，常用的有精神分析法、厌恶疗法、系统脱敏疗法、家庭疗法等。
