如果症状比较轻微，可以多饮水、注意休息、忌辛辣饮食、避免性生活、清洗局部改善。如果较明显或症状持续时间较长，到医院进行尿常规化验、泌尿系B超检查，为泌尿系感染后可口服抗生素治疗。
可以选择服用抗生素进行治疗，或者口服抗菌的消炎药。物理治疗，生物电反馈治疗，利用生物电刺激盆底肌群，提高盆底及其周围肌群组织细胞的活力，改善局部血液循环。
阴茎痛多考虑为阴茎的炎症反应和海绵体损伤而出现，每天清洗外生殖器，保持局部卫生，要到专业的泌尿外科和男科，检测龟头敏感度和阴茎海绵体血流多普勒，这样才能明确判断，有针对性的治疗。
各种外伤、蚊虫咬伤、丘疹或表皮外伤。性交过度。生殖器皮肤感染。前列腺炎常引起阴茎疼痛，可能因为阴茎受到感染或受刺激导致。尿道炎和淋病主要通过性行为传染产生疼痛症状。
阴茎疼痛可能是尿路感染或结石、前列腺炎等泌尿系疾病引起的疼痛，建议到正规医院泌尿科检查，明确病情，对症治疗。合理性生活，不要频繁。平时要多吃蔬菜等富含维生素，微量元素的食物，还要避免饮食辛辣刺激，效果更好。