肾脓肿需要去泌尿外科进行药物的对症处理，如果使用了敏感的、高效的药物，可以在一个星期内缓慢的消失，从而得到完全的治愈。
积极治疗一星期以后，抗生素的应用依然没有任何作用，脓肿没有消失，也没有继续扩张，蔓延，会引起发烧，寒战等症状，这是因为保守疗法不管用，需要更换抗生素，还要做B超和CT引导下的抽吸引流，这样才能将脓液从脓腔内排出，并且在初期应用一些抗生素。
肾脓肿的治疗费用在1万-3万元左右，不同的手术治疗方法费用不同，治疗效果也不同。使用一些简短的治疗方法已经难以达到理想的治疗效果，长期下去费用也不会少。由于每个地区，每个医院的收费标准不同，技术成本不同，治疗的费用也是不同的。
治疗肾脓肿大概花1万元-3万元左右。肾脓肿通常是由于急性肾盂肾炎继续发展，发生坏死并形成含有脓液的腔。糖尿病和感染性结石通常是肾脓肿发病的潜在因素。偶尔肾囊肿继发感染也可形成肾脓肿。肾包膜下脓肿可发展为肾周脓肿，然而肾脓肿与肾周脓肿比较起来，单独存在的情况更少。
切除治疗术，早期肾穿刺造瘘鵻，充分引流，观察肾功能恢复情况若肾功能恢复鵻，则矫治梗若，功能鵻不能恢复，且对侧肾功能良好者，应行患侧肾切除术；保守治疗，选择敏感有效的抗生素，有助于将脓肿控制，消灭在早期阶段。
药物治疗结合早期的引流。传统的治疗提倡切开脓肿引流，在超声或CT引导下经皮穿刺安置适当大小的引流管也可以。如经皮引流无效时，必须及时切开引流或作肾切除术。对于肾周脓肿来说，仅用抗生素治疗是不够的。
