肉芽肿性前列腺炎的治疗包括药物、局部理疗和手术等。不同病因，服用不同抗生素等免疫抑制剂等药物。有局部或全身感染症状及继发于特异性感染的肉芽肿性前列腺炎，需抗感染治疗，疗程一般为两到四周。
以抗菌消炎药为主，辅以中药治疗。抗生素和消炎药要交替应用2～3个月，中药治则为：补肾阴、软坚、活血化瘀、清热解毒、化湿利水。胎盘组织液肌内注射亦有显著疗效。少数有严重梗阻症状的病人需行前列腺切除。
初期肉芽肿性前列腺炎的治疗应根据不同的病因选用药物、局部理疗或手术治疗。以抗菌消炎药为主，辅以中药治疗。抗生素和消炎药要交替应用2～3个月，治疗及时肿块迅速消失。
坚持清洗会阴部是预防前列腺炎的个重要环节另外每次同房都坚持冲洗外生殖器是很有必要的。平时要多喝温开水，多吃新鲜的蔬菜和水果，饮食宜清淡，不宜吃油腻及辛辣刺激的食物，不能喝酒。注意休息，不能熬夜，放松压力，保持愉快心情。
考虑到肉芽肿性前列腺炎的可能，需在B超引导下行前列腺穿刺活检以明确诊断。若无条件活检，可用抗生素或消炎药治疗观察，每2周行直肠指检1次，2个月后，1～2个月1次，直肠指检若硬结变小，其他正常，即可确诊。
影像学检查。经耻骨上B超或经直肠B超可见前列腺内低回声结节，或前列腺回声不均，与前列腺癌相似。其他B超所见有前列腺增大、形态不规则但包膜完整等。MRI对诊断帮助不大。注意发现个别与本病并发的前列腺癌。
